生化小课 | 常见的二级结构具有特征性的二面角

2023-09-19 08:31:45 浏览数 (1)

医学生:生理生化 必有一挂

生科/生技:生化书是我见过最厚的教材

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每周一堂

生化小课

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常见的二级结构具有特征性的二面角

α螺旋和β构象是多种蛋白质中主要的重复二级结构,尽管在某些特殊蛋白质中还存在其他重复结构(例如胶原蛋白,见图 4-12)每一种二级结构都可以通过与每个残基相关的二面角φ和ψ来完整描述。Ramachandran图是由G.N. Ramachandran引入的,是将特定蛋白质结构中观察到的所有φ和ψ角可视化的有用工具,通常用于测试三维蛋白质结构的质量。在Ramachandran图中,定义α螺旋和β构象的二面角落在空间允许结构的相对有限的范围内(图4-8a)。已知蛋白质结构的φ和ψ的大部分值落在预期的区域,如预测的那样,α螺旋和β构象值附近浓度较高(图4-8b)。唯一经常在这些区域之外的构象中发现的氨基酸残基是甘氨酸。由于Gly残基的侧链很小,它可以参与许多其他氨基酸在空间上禁止的构象。在这些区域之外的构象中经常发现的唯一氨基酸残基是甘氨酸。由于其侧链较小,甘氨酸残基可以参与许多其他氨基酸在空间上禁止的构象

Principles of Biochemistry

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