CNGBdb有哪些实用科学数据库?【果蝇胚胎和幼虫的3D时空图谱】 | CNGBdb-Question Time

2023-09-20 15:03:26 浏览数 (1)

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07 /Flysta3D

果蝇胚胎和幼虫的3D时空图谱

db.cngb.cn/stomics/flysta3d/

Flysta3D属于深圳国家基因库(CNGB)与华大生命科学研究院共同打造的时空组专辑数据库系列,研究团队利用时空组学技术,构建了模式生物果蝇的晚期胚胎和幼虫的3D时空发育图谱,鉴定了发育中果蝇中肠的空间亚区,解析了幼虫精巢细胞命运的转变,揭示了果蝇发育过程中潜在的空间转录因子调控网络。

数据资源

Flysta3D旨在管理由Stereo-seq生成的果蝇胚胎和幼虫所有阶段的三维空间转录组数据。

主要功能

Flysta3D通过可视化和分析感兴趣的基因空间表达模式、聚类和注释3D重建组织特异性的空间转录组,模拟组织发育过程中的发展轨迹,识别细胞信号通路和基因调控网络,在完整的空间环境中检查基因功能等。用户可通过数据库主页面或导航栏,快速获取此项研究的内容梗概、时空聚类分析结果、3D模型、研究技术(Stereo-seq)简介、研究中使用分析软件及产生的数据资源信息,同时还能直接下载研究数据。

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