测序原理
- 测序是测生物体的遗传信息
一代测序:
sanger发明的70年代的双脱氧终止反应法
原理如下:
- DNA的基本组成单位是单脱氧核苷酸(dNTP),dNTP5点位和3点位各有一个羟基。
- sanger合成了3点位没有羟基的核苷酸(ddNTP),由于无法与下一个dntp形成磷酸二酯键,终止了DNA的聚合反应。
二代测序:
illuma公司的合成测序方法为主流
原理如下:
- 桥式PCR扩增--DNA链进入flow cell(流动池)配对互补后,加入DNTP和聚合酶合成、加入NAOH碱溶液解开,加入中性溶液又折叠再次互补,由此一直重复。
- 测序过程加入4种红黄蓝绿不同荧光标记的dNTP进行互补配对,通过荧光判断碱基是哪一种
- 二次测序读取Index(最开始文库里人工加的DNA接头),可以确认DNA片段来自哪个样本