学习小组笔记Day3-秦瑶 Linux环境下的软件安装

2023-04-06 20:56:37 浏览数 (3)

想了一下还是想再写笔记,尽管被删了好几次。

主要内容如下:

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wget  连接 #下载
bash  链接 #安装
source ~/.bashrc #激活conda

添加镜像 中科大镜像

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conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
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conda list
conda install fastqc -y
fastqc --help
conda remove fastqc -y
conda info --envs
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
conda activate rna-seq
conda deactivate 

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