一、r语言基础
>生信技能树二、数据类型
数据类型：数值型（numeric)，字符型（character，必须加" "or' '），逻辑型（TRUE FALSE NA存在但未知）
null 不存在
判断数据类型的函数class()
unexpected: 代码错误的关键词
1）逻辑型数据
比较运算的结果是逻辑值
< <= >= == !=
逻辑运算：与& 或| 非!
2）数据类型的判断与转换
is族函数判断
>生信技能树as族函数实现数据类型转换
>生信技能树3）数据类型转换的优先顺序
字符型 > 数值型 > 逻辑型
三、数据结构
数据框约等于表格 每一列只能有一种数据类型
数据框单独一列是向量，视为一个整体
向量里只有一种数据类型，但是可以有重复值
向量<数据框<矩阵<列表
1.向量的生成
代码语言：javascript复制#(1)用 c() 结合到一起
c(2,5,6,2,9)
c("a","f","md","b")
#(2)连续的数字用冒号“:”
1:5
#(3)有重复的用rep(),有规律的序列用seq(),随机数用rnorm()
rep("x",times=3)
rep('a','b','c',each = 3)
seq(from=3,to=21,by=3)
rnorm(n=3)
#(4)通过组合,产生更为复杂的向量。
paste0(rep("x",times=3),1:3)补充：paste和paste0的区别，paste默认sep=空格，paste无sep
代码语言：javascript复制paste(c("a", "b","c"),1:3)##默认空格符
## [1] "a 1" "b 2" "c 3"
paste(c("a", "b","c"),1:3,sep=" ")
## [1] "a 1" "b 2" "c 3"
paste(c("a", "b","c"),1:3,sep="")
## [1] "a1" "b2" "c3"
#如果两个向量长度不同
paste(c("a", "b","c"),1:5)##超出范围后继续从前向后连接
## [1] "a 1" "b 2" "c 3" "a 4" "b 5"
#paste0的表现
paste0(c("a", "b","c"),1:3)#默认元素连接为sep=""
## [1] "a1" "b2" "c3"https://www.jianshu.com/p/44e3de9b7a81
2.对单个向量进行的操作
代码语言：javascript复制#(1)赋值给一个变量名
x = c(1,3,5,1) #随意的写法
x <- c(1,3,5,1) #规范的赋值符号 Alt 减号
#赋值 输出一起实现
x <- c(1,3,5,1);x #写在一行必须用';'
(x <- c(1,3,5,1)) 
>生信技能树#(2)简单数学计算
x 1
log(x)
sqrt(x)
#(3)根据某条件进行判断,生成逻辑型向量
x>3
x==3#(4)初级统计
max(x) #最大值
min(x) #最小值
mean(x) #均值
median(x) #中位数
var(x) #方差
sd(x) #标准差
sum(x) #总和
length(x) #长度
unique(x) #去重复，从左往右第一次出现不叫重复，此后出现叫重复
duplicated(x) #对应元素是否重复，从左往右第一次出现不叫重复，此后出现叫重复
!duplicated(x) #无重复TRUE，重复FALSE
table(x) #重复值统计
sort(x)
sort(x,decreasing = F) #F为默认值
sort(x,decreasing = T)3.对两个向量的操作
代码语言：javascript复制x = c(1,3,5,1)
y = c(3,2,5,6)
#(1)比较运算，生成等长的逻辑向量
x == y
y == x
#(2)数学计算
x y
#(3)连接
paste(x,y,sep=",")
#当两个向量长度不一致
x = c(1,3,5,6,2)
y = c(3,2,5)
x == y #最后结果和最长的那个有关；循环补齐
#利用循环补齐简化代码
paste0(rep("x",3),1:3)
paste0("x",1:3)
#(4)交集、并集、差集
intersect(x,y) #交集
union(x,y) #并集
setdiff(x,y) #仅在x中有的结果
setdiff(y,x) #仅在y中有的结果重点：%in%
代码语言：javascript复制x %in% y #x的每个元素在y中存在吗
y %in% x #y的每个元素在x中存在吗
>生信技能树4.向量筛选（取子集） []: 将TRUE对应的值挑选出来，FALSE丢弃
代码语言：javascript复制x <- 8:12
#根据逻辑值取子集
x[x==10]
x[x<12]
x[x %in% c(9,13)]
#根据位置取子集
x[4]
x[2:4]
x[c(1,5)]
x[-4]
x[-(2:4)] #-表示删掉元素- 表示删掉元素，与python区分
总结：
按照逻辑值：中括号里是与x等长且一一对应的逻辑值向量
按照位置：中括号里是由x的下标组成的向量
按条件挑选某个向量中两种类型的子集
x为向量 y为条件
x[x%in%y]
5.修改向量中的某个/某些元素：取子集 赋值
代码语言：javascript复制#改一个元素
x[4] <- 40
x
#改多个元素
x[c(1,5)] <- c(80,20)
x变量的修改需要赋值操作
6.简单向量作图
代码语言：javascript复制k1 = rnorm(12);k1
k2 = rep(c("a","b","c","d"),each = 3);k2 #each和times不同，
plot(k1)
boxplot(k1~k2) #k1纵坐标，k2横坐标补充练习题
代码语言：javascript复制#生成10个随机数: rnorm(n=10,mean=0,sd=18)，用向量取子集的方法，取出其中小于-2的值
rnorm(n=10,mean=0,sd=18)
z=rnorm(n=10,mean=0,sd=18)
z[z<(-2)] #不打括号<-为赋值，给出的结果与期望不符
z[z< -2] #空格隔开运行顺序：有嵌套先里后外，无嵌套从左到右
