生信入门课DAY3--向逸一

1、将miniconda下载到服务器上

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wget  下载链接

（下载链接https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh）

2、安装miniconda

step1:安装

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bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 

（按提示操作，直至thank you for installing Miniconda3)

step2：激活

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source ~/.bashrc

（验证激活，输入conda出现满屏信息代表激活成功）

如果激活不成功，删除文件（rm -r /home/bio06/miniconda3），重新安装

3、添加镜像

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# 使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

4、使用conda

step1：查看当前服务器上安装的所有软件列表

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conda list

step2：安装软件

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conda install fastqc -y 

【-y是yes，安装过程中conda问你的问题全部回答yes】

step3：确认fastqc软件是否安装成功

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fastqc --help

如果出现一大片文字（帮助文档），已经安装成功

step4：卸载软件

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conda remove fastqc -y

conda 镜像 软件

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