【单细胞】2020国自然研究热点中标摘要参考

2023-02-28 19:21:35 浏览数 (1)

小站VIP群里有中标标书的摘要,不过大家使用的并不全面站长挑选几个研究热点的摘要,本期的主题是单细胞测序。

单细胞测序

单细胞测序-1*

膀胱癌是常见的泌尿系统恶性肿瘤,极易复发和转移,有效针对膀胱癌干细胞(BCSC)的治疗是减少其复发和转移的关键。现有的BCSC标志物单一有限,无法精确分离BCSC,其“干性”产生机制不详。申请人在前期单细胞基因组的研究基础之上,进一步从单细胞转录组水平对BCSC展开研究,完成了四例样本953个细胞的测序。本项目拟基于单细胞表达谱精确定位BCSC亚群并提取其表达特征:(1)推测潜在细胞表面分子标记,通过成球培养和异种移植最终确定BCSC新标志物。(2)通过基因注释及数据库临床关联,筛选肿瘤“干性”关键基因,通过基因过表达实验进行功能验证,并进一步推测肿瘤“干性”产生的分子机制。本研究有望鉴定一批BCSC的新标志物,揭示调控其“干性”的分子机制,为BCSC的靶向治疗提供潜在靶点和科学依据。

单细胞测序-2*

肺腺癌发生远处转移的患者预后不良,且常见其外周血中血小板计数显著高于未转移者,提示血小板数目异常及其功能失调与肺癌转移密切相关。本课题组通过单细胞测序技术发现肺腺癌转移患者血小板长非编码RNAxxxxx明显升高,而外泌体xxxxx也显著升高,荧光跟踪技术显示外泌体可被血小板运输至肺癌细胞微环境中,并被肺癌细胞吞入细胞内。干扰或过表达lincxxxx后,肺癌的侵袭和转移能力受到明显影响。同时生物信息学分析提示lincxxxx可绑定Exx2调控Fxxs的表达。据此推测血小板作为载体,通过外泌体将高表达的lincxxxx运输到肺癌细胞微环境中,增加了肺癌细胞的侵袭能力,从而促进肺腺癌的转移。本项目拟运用二代测序、RIP、ChIP等技术揭示上述假设,通过体内外实验和临床样本分析加以验证,以期获得肺腺癌患者发生转移的新机制。

单细胞测序-3*

肺癌是严重危害人类健康的一种恶性肿瘤,非小细胞肺癌约占肺癌80-85%,Oxx4 非小细胞肺癌细胞具有显著的致瘤、转移与耐药性。单细胞分析技术为肿瘤的特异性靶向治疗策略提供了精准的研究手段。本研究通过对局限期NSCLC病人原发组织单细胞和进展期病人外周血CTC富集、捕获,进行全基因组扩增与全外显子组测序。生物信息学分析产生用于挖掘的reads,从而对每个样本的SNV/INDE,CNV进行分析。对SNV/INDEL进行重现率分析与高频突变位点筛选、外部数据比对与注释、蛋白质功能预测等;对CNV筛选gain or loss区域、基因注释与功能分析。比较病人的单细胞间、不同病人之间以及两组之间SNV/INDEL, CNV类型异同。通过单细胞WES分析,比较OCT4 原发组织单细胞与CTC在突变组水平的差异,探索局限期与进展期突变组的异同,发掘NSCLC驱动基因以及潜在的靶标突变基因。

*素材均来自于网络

ip

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