安装软件 linux上很多软件安装的时候需要配置环境还要安装一堆依赖的软件什么的,对于负基础的人来说一下子就蒙了,不过站长有个好方法可以帮助大家解决一下燃眉之急~
Talk Less,Show Dry-Goods!
安装miniconda
miniconda相对于是R中的bioconductor,相对于ISO App Store,相当于应用商店。你只要用一个命令,搭建环境和依赖软件什么的,这类对于负基础人群来说讨厌的操作,conda通通一次性解决如果你按照下面的教程已经获得了一台云服务器,那么按照如下操作进行。wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shbash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh中间遇到任何yes和enter,大家记得敲yes和回车,结束之后要另打开一个终端重新登录下面是按照biocond channelconda config --add channels defaults上面那条运行之后那个提示不用管conda config --add channels conda-forgeconda config --add channels bioconda
bioconda如何安装应用程序
只需要一个命令conda install xxxxxxxx就是你要安装的软件比如:star fastqc cutadapt R samtools bedtools 等等想知道还有那些软件请浏览下面的网址https://bioconda.github.io/recipes.html