TCGAbiolinks有可能会出现GDC server down的情况,用下面命令安装开发版即可解决 devtools::install_github(repo = "BioinformaticsFMRP/TCGAbiolinks") 如果还是安装失败,或者有bug,大家也可以像站长那样 在网页登陆云服务器去使用Rstudio TCGAbiolinks 然后用fileZilla把数据传到自己电脑上 Rstudio TCGAbiolinks 已经做好了腾讯云镜像(北京), 小站所有已经加入Chris转录组初级教程星球的小伙伴,都可以免费共享, 需要的话发送腾讯云账户ID给站长微信即可~~~~ 小站最火的零基础转录组分析教程有优惠了 主讲人,Chris LouChris生命科学小站创始人,神经外科医生,Wet-Dry实验兼修发表SCI论文9篇,以第一作者发表SCI论文三篇,单篇最高10.02。 课程介绍如果你自己有测序结果想省点钱自己分析如果你想挖掘那些NCBI中RNA-seq原始测序数据如果你想预测某些基因下游的通路如果你已经学会了各种R语言教程但是发现服务器好贵那么,还等什么加入这个教程能够教会你,每个样本只花不到10元的价格。从这些数据
到下面这些图
教程将提供: 1、所有与教程有关的R的所有脚本、教程所用的教学数据。 2、赠送网易云课程等价值课程。 3、提供免费共享云服务器工具镜像,并享受VIP级的答疑服务。 课程目录: 1、Linux命令与服务器将不是学习生信的障碍——如何建立适合转录组分析的便宜云服务器。 2、如何高速下载SRA数据(RNA-seq原始数据)。 3、这些数据能用吗?(数据的质量与链特异性检测)。 4、STAR分析转录组的流程。 5、相关Linux批量处理数据命令介绍。 6、DEseq2统计分析差异基因。 7、测序数据怎样进行GSEA分析。 8、热图与火山图,GO与KEGG的可视化。