Server "To be, or not to be, that is a question:......"—William Shakespeare
站长的吐血历程
在过去的近两个月中，站长一直在准备环状RNA的课程环状RNA（circular RNA）研究如火如荼，作为数据挖掘的生力军，可挖程度比miRNA，lncRNA 强了n倍。配合之前SRA的教程，挖几个环状RNA，真的是做一点验证或者不做，随便发个文章什么的。思来想去站长选择了以下两个软件：DCC (https://github.com/dieterich-lab/DCC)STARChip (https://github.com/LosicLab/starchip)原因么这两个软件都是基于STAR结果分析，与之前教程衔接紧密。但是，然而，HOWEVER......使用starchip的时候，遇到的bug比想象的多，折腾了足足一个月，最后，跟其作者尼古拉斯交流软件改进bug，然后就没了。从效率来看STARChip简直是高效的不要不要的Mapping一次之后，编辑两个文件，然后两步shell，直接出图尼古拉斯的想法是好的，但软件还不完美，虽然沟通之后表示会更新比如Step1.sh的代码，比如链特异性，比如R gplot那个包的问题~~~种种折腾了一个月之后，放弃了使用STARChip换DCC试一下虽然DCC有些繁琐，比如双端测序你需要Mapping 3次比如输出的文件中，只有干巴巴的表格但是，DCC是可以用的~~~但是，DCC真的是很烧钱的 云服务器还是本地服务器 如果你是生信小白，刚刚入门的负基础学员如果你仅仅是想练习学到的生信技能，如果你仅仅是要分析3-5个项目的数据（样本数不过百）如果你仅仅是挖个数据发一篇文章那么站长还是推荐云服务器 划重点 为了给大家再省一点钱，这里在强调一下！！！腾讯云服务器只有销毁才不会收费！！！如果想备份系统盘，在销毁清制作镜像备份！！！如果想备份数据盘，在销毁前用快照去备份！！！但是，快照的云硬盘不能销毁，销毁了快照备份的数据就没有了！！！所以，如果做那些对空间要求较多的分析比如DCC，那么云服务器就不是一个划算的选择。站长估计了一下用DCC挖掘环状RNA每个样本至少需要25元，样本数量越多成本会越高。 站长在后一个月研究DCC的过程中烧光了所有课程的收入，关键是备份快照所关联的云硬盘被站长不小心删掉了。这就意味着之前一个月DCC分析的数据都Just Gone！哎~（深深的叹一口气）所以现在让站长选本地还是云服务器，果断选本地的！因为站长还想给大家带来跟多的课程站长躲过了单反的坑，没想到入了生信的坑。塔式服务器正在运输中，等搭建好一切站长会总结这次本地服务器搭建过程，把经验分享给大家有资金的，长期分析的还是弄个本地服务器吧~
不幸中的万幸
站长保住了DCC分析环状RNA的工具镜像。也就是说以后想挖掘环状RNA，用这个镜像就可以直接调用DCC去分析啦~~~ 于是站长有个大胆的想法~~~~~早晚是要给大家讲环状RNA的挖掘教程不如搞个预售，课程的名字叫Chris带你挖掘环状RNA这个课程定价999，课程准备期间加入星球只要599，送DCC分析镜像课程预计45天后上线，到时候恢复999价格课程主要内容就是从公共数据挖掘环状RNA另外会讲一些站长研究环状RNA的实验技能以及课题思路什么的~
