oncoplot （瀑布图）经常出现在肿瘤研究中的Fig1 ，可以展示多种变异类型的全景图。
前面介绍过了使用maftools包 对MAF文件进行绘制maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot（瀑布图），以及使用ComplexHeatmap 包对excel文件进行绘制ComplexHeatmap|根据excel表绘制突变景观图（oncoplot）。
当我只有基因和变异类型的时候，那就想办法整理成 excel的形式，然后使用ComplexHeatmap绘制。
一 载入R包，数据
代码语言：javascript复制#加载R包
library(tidyverse)
library(openxlsx)
library(reshape2)
library(ComplexHeatmap)
#读取数据
data <- read.xlsx("test.xlsx",sheet = 1)
head(data)
tail(data)
信息好少，但是好在绘制瀑布图的核心信息都在。
A：距离maf文件差距好大，放弃！
B：距离推文的excel表格（下图），好像差异不大 。
就是长 转 宽 ，然后多种Exonic_Function的就用逗号分隔就行。
二 数据转化
长型，宽型互转的方式有很多，可以使用tidyr包的gather ，spread函数进行长宽互转Tidyverse|tidyr数据重塑之gather，spread（长数据宽数据转化） ；也可以使用 reshape2包的melt 和 cast函数进行长宽互转数据处理|数据框重铸 。
2.1 使用reshape2包的dcast函数
代码语言：javascript复制#尝试转化
dcast <- dcast(data, gene~ sample)
head(dcast)
和想象的好像有点不一样，是不是有很多问号❓
这里不应该是基因名字吗？为什么是数值？数值又代表的什么含义呢？
注意看一下提示信息，“Aggregation function missing: defaulting to length” ，提到因为Aggregation function missing，默认是length。说明现在的数值代表length ，而length也就是个数。
那如果Aggregation function 不默认，是用什么参数设置呢？可以自定义成Exonic_Function使用逗号连接吗？
2.2 擅长使用R帮助
使用 ?dcast 看一下，发现fun.aggregate就是我们想要的参数，
