Linux和UNIX的文件系统是一个以“/ “为根的阶层式的树状文件结构，/ 因此被称为根目录。所有的文件和目录都置于根目录/ 之下。根目录/下面有/bin，/home，/usr等子目录。在早期的UNIX系统中，各个厂家各自定义了自己的UNIX系统的文件系统构成，比较混乱。
为了避免在Linux也产生同样的问题，在Linux面世不久，就开始了对Linux文件系统进行标准化的活动，于1994年推出了名为FSSTND(Filesystem Standard)的Linux文件系统层次结构标准。之后，FSSTND标准吸引了UNIX社团的开发人员，他们把FSSTND扩大到UNIX系 统，FSSTND就变为FHS (Filesystem Hierarchy Standard)。2001年3月，FHS 2.2版本发布，2004年1月29日发行了最新版本2.3。
FHS标准使得众多的Linux发布包有了可以遵循的标准，使得软件和用户可以预测已经安装了的文件和目录的位置。它定义了如下的内容
定义了文件系统中每个区域的用途
定义了所需要的最小构成的文件和目录
给出了例外处理和矛盾的特殊例子
FHS实际上仅是规范在根目录（/）下面各个主要目录应该放什么样的文件。FHS定 义了两层规范，第一层是， / 下面的各个目录应该要放什么文件数据，例如 /etc应该要放置设置文件，/bin与 /sbin则应该要放置可执行文件等等。第二层则是针对 /usr及 /var这两个目录的子目录来定义。例如 /var/log放置系统登录文件、/usr/share放置共享数据等等。
由于FHS仅是定义出最上层（/）及子层（/usr, /var）的目录内容应该要放置的文件数据，因此，在其他子目录层级内，就可以随开发人员自行配置了。举例来说，FC4的网络设置数据放在 /etc/sysconfig/network-script/ 目录下，但SuSE Server 9则是将网络放在/etc/sysconfig/network/ 目录下，目录名称是不同的.
/ | 根目录 |
|---|---|
/bin | 一般用户使用的命令 |
/boot | 放置内核及LILO、GRUB等导引程序(bootloader)的文件，用于启动。 |
/dev | 硬盘，分区，键盘，鼠标，USB，tty等所有的设备文件都放在这个目录。 |
/etc | 系统的所有配置文件都存放在此目录中。 |
/home | 用户空间，所有的用户都是用此空间。 |
/lib | 共享连接库，如C库和C编译器等等。 |
/media | 挂接CD-ROM等设备的目录 |
/mnt | 移动设备文件系统的挂点 |
/opt | 存放后来追加的用户应用程序 |
/root | 管理员之家 |
/sbin | 存放系统管理所需要的命令 |
/tmp | 临时文件目录，重新启动时被清除 |
/usr | 存放只能读的命令和其他文件。 /usr/X11R6 X Window系统 /usr/bin 用户和管理员的标准命令 /usr/include c/c 等各种开发语言环境的标准include文件 /usr/lib 应用程序及程序包的连接库 /usr/local/ 系统管理员安装的应用程序目录 /usr/local/share 系统管理员安装的共享文件 /usr/sbin 用户和管理员的标准命令 /usr/share 存放使用手册等共享文件的目录 /usr/share/dict 存放词表的目录（选项） /usr/share/man 系统使用手册 /usr/share/misc 一般数据 /usr/share/sgml SGML数据（选项） /usr/share/xml XML数据（选项） |
/var | 存放应用程序数据和日志记录的目录，例如，Apache Web服务器的文档一般就放在/var/www/html下。 /var/cache 应用程序缓存目录 /var/account 处理账号日志（选项） /var/crash 系统错误信息（选项） /var/games 游戏数据 /var/lib 各种状态数据 /var/lock 文件锁定纪录 /var/log 日志记录 /var/mail 电子邮件 /var/opt /opt目录的变量数据 /var/run 进程的标示数据 /var/spool 存放电子邮件，打印任务等的队列目录。 /var/spool/rwho /var/tmp 临时文件目录 /var/yp NIS等黄页数据（选项） |
