英文标题：Liver type 1 innate lymphoid cells develop locally via an interferon-g-dependent loop
发表期刊：Science
作者：白璐、唐玲、Margaux Vienne、Yann Kerdiles为共同第一作者，田志刚教授、彭慧教授、孙汭教授、Eric Vivier 教授为通讯作者
通讯作者所在单位：中国科学技术大学
田志刚院士团队通过单细胞测序技术发现一类肝源免疫细胞ILC1，ILC1的发育依赖于IFN-γ的调控。该研究发现了免疫细胞髓外发育新途径，为肝脏天然免疫的形成提供了重要的理论依据，同时证明了单细胞测序技术在基础研究中越发重要的作用。
本研究发现由ILC1s产生的IFN-γ通过影响其原代细胞的增殖进而促进自身发育的过程。首先，与骨髓中存在NK祖细胞相比，肝脏中存在ILC1祖细胞与肝脏IFN-γ ONILC1原位优先作用是一致的。第二，IFN-γ积极促进silc-1(casps3)的分化，因为LSM细胞表达IFN-γ受体，这种信号通路在这些细胞中是活跃的。这一发现得到了scRNA-seq数据的支持，该数据揭示了IFN-γ诱导的基因 [如干扰素调节因子Irf1和Irf2、信号转导子和转录激活子1（Stat1）、Cd44和β-2微球蛋白（B2m）] 在这些细胞中表达。最后，IFN-γ信号以T-bet依赖的方式促进LSM细胞的增殖和分化，而不是ilc-1细胞的增殖和分化。然而，ILC1分泌的IFN-γ促进ILC1的分化，而cNK细胞分泌的IFN-γ不支持ILC1分化的这一观点仍有待确定。
本研究揭示了外周造血干细胞对特异性免疫细胞起源的贡献以及肝脏内独特的区域免疫特征，扩展了我们对髓外造血及淋巴细胞来源的认识。
本研究中单细胞测序相关研究结果
Fig. 1. scRNAseq analysis of liver LSM cells and Lin−CD122 CD49a cells.
Fig. 2. LSM cells expressed IFN-γ-stimulated genes. Feature plots of relative levels of Ifngr1, Ifngr2, Irf1, Irf2, Cd44, Stat1, and B2m expressions on sorted LSM cells using scRNAseq analysis.
单细胞测序不仅能够在研究的最初阶段增加学者们对生命进程的认知与理解,同样重要的是,在实验阶段,单细胞测序取得的数据相比于传统的实验更具有说服力。
