细胞之间的相互作用可以协调生物的发育,体内稳态和单细胞功能。当细胞不能正确地相互作用或不正确地解码分子信息时,疾病便随之而来。因此,细胞间信号通路的鉴定和定量已成为跨不同学科进行的常见分析。蛋白质-蛋白质相互作用数据库的扩展以及RNA测序技术的最新进展,使得从大量和单细胞数据集的基因表达测量中进行细胞间信号传导的常规分析成为可能。特别是,配体-受体对可用于从其同源基因的协同表达中推断细胞间的通讯。今天给大家介绍一篇2021年新鲜出炉的Nature综述,在这篇综述中,作者重点介绍了通过转录组数据分析细胞间相互的方法和工具。
下面表里列出了目前比较主流的用于做细胞通讯的软件(点击查看大图)