1 R语言简介
1.1 R 语言的历史
R语言来自S语言,是S语言的一个变种。S语言由Rick Becker, John Chambers等人在贝尔实验室开发, 著名的C语言、Unix系统也是贝尔实验室开发的。R是一个自由软件,GPL授权, 最初由新西兰Auckland 大学的Ross Ihaka 和 Robert Gentleman于1997年发布, R实现了与S语言基本相同的功能和统计功能。 现在由R核心团队开发,但全世界的用户都可以贡献软件包。
1.2 R 语言的特点
自由软件,免费、开放源代码,支持目前流行的主要系统
这个特点还不够吗!!!!(要啥自行车( ̄△ ̄;))
1.3 推荐书籍
一本都没看过、 (  ̄ー ̄)
Hadley Wickham and Garrett Grolemund(2017) “R for Data Science”
https://r4ds.had.co.nz/
Hadley Wickham(2019) “Advanced R,” 2nd ed.
https://adv-r.hadley.nz/
Hadley Wickham(2016) ggplot2 Elegant Graphics for Data Analysis, 2nd ed.
https://ggplot2-book.org/
2 下载并安装R
本次以mac os(m1)为例,打开
https://www.r-project.org/
2.1 选择新版本R
2.2 选择清华镜像
2.3 按不同操作系统选择不同版本R,在这里我选择mac os
2.4 由于mac存在不同芯片问题,m1和intel,大家可根据芯片选择不同版本。
Note! 提醒大家一下,如果大家需要经常使用Bioconductor上的包进行生信分析的话,即使你是M1的用户,也推荐你选择intel版本的R
2.5 最后一路狂飙到最后,安装完成就行啦~
3 下载并安装RStudio
安装完R语言后就可以安装RStudio了,Rstudio是R的一个IDE,图形功能强大,可以更方便地使用R, R就好比一个相机的机身,Rstudio就好比相机的镜头,镜头可以买贵的便宜的,但都要再这相机机身上用。
3.1 打开Rstudio官网
https://www.rstudio.com/products/rstudio/
,
3.2 下载Rstudio Desktop,当然是free版啦
3.3 对应自己的操作系统选择相应版本,这里我选择mac 版
3.4 下载好以后,一路狂飙到最后就行啦
4 R studio 界面介绍
- A: 脚本编写区。这个区域编写的R代码可以删除、修改。点击“run”,运行单条命令,点击“source”,运行编辑好的所有命令。常用快捷键:
command
return
(有兴趣了解所有快捷键的可以用option
shift
k
查看) - B: 数据显示区。显示在R里面输入的历史数据。
- C: 命令运行区。代码运行的结果和错误都会在这个区域展示。
- D: 绘图和求助区域。
5 基础设置
先不要着急写代码,先做几个基础设置
5.1 点击Tools -> Global Options
(Mac 快捷键 command
,
)
5.2 工作目录
通过Browse
选择默认工作路径,但还是推荐大家通过setwd()
或新建project
的方式设定工作目录
5.3 设置主题
通过font size
和theme
设置成你喜欢的字体大小和主题就行,萝卜青菜,各有所爱(O_o)(o_O)
5.4 设置镜像
通过change
选择离自己最近的镜像地址