简介
前段时间，对这 6 幅图进行了学习，并汇总了各图的知识点和使用技巧。在此做个总结，以便查阅（可点击图片直接跳转）。
对应代码可在 GitHub - marco-meer/scifig_plot_examples_R: Scientific publication figure plotting examples with R[1] 可以找到。
A
主要知识点
- 学会如何导入图形，并将其并排展示；
- 学会设置自定义主题，简化代码，统一主题，方便绘制其他图形使用；
- 学会使用 ggplot2 包内置参数添加文字已经其他其他修饰图标。
- 使用
magick包中的image_read()导入两幅图，并通过image_flip()进行转化； - 设置自定义主题
my_theme，方便绘制其他图形使用； - 使用
annotate()添加文字（"text"），使用geom_segment()添加线段。
B
主要知识点
- 学会定义密度函数，并在图形中将其添加；
- 学会设置自定义主题，简化代码，统一主题，方便绘制其他图形使用；
- 学会添加子图、给坐标轴添加修饰图形；
- 学会添加带有特殊符号的公式。
- 自定义密度函数，并使用
stat_function()在图形中将其添加； - 设置自定义主题(
my_theme)，简化代码，统一主题，方便绘制其他图形使用； - 使用
annotation_custom()添加子图； - 使用
ggforce包中的geom_regon()函数绘制修饰图形； - 使用
expression()函数添加带有特殊符号的公式。
C
主要知识点
- 学会转化数据为图形所需的数据格式；
- 学会绘制三变量的箱线图；
- 学会绘制带抖动的散点图并修改透明度。
- 使用基础包的
data.frame()和rep()整理和转化数据； - 使用
geom_boxplot()绘制箱线图并添加第三个变量； - 使用
position = position_jitterdodge()将散点分散展示。
D
主要知识点
- 实现双 Y 轴；
- 学会修改坐标轴为对数尺度；
- 添加坐标轴的微小刻度线。
- 使用
annotation_custom(ggplotGrob())图中添加其他图形； - 使用
scale_x_log10()和scale_y_log10()对刻度进行对数变换； - 使用
annotation_logticks(sides = "b")添加 x 轴的 ticks； - 使用
scale_y_continuous(position = "right")改变 Y 轴位置。
E
主要知识点
- 绘制散点图、丝带形状图；
- 绘制横向、纵向误差图；
- 学会小技巧：展示轴外部的图形。
- 使用
geom_point()绘制散点图，geom_ribbon()绘制丝带形状图； - 使用
stat_function()添加函数曲线； - 使用
geom_errorbar()和geom_errorbarh添加误差棒（纵向与横向）； - 使用
coord_cartesian(clip = "off")允许展示外轴的图形。
F
主要知识点
- 使用
annotation_logticks()添加对数刻度。 - 使用
scale_size()修改散点的大小范围； - 使用 viridis 包中的配色样式
scale_fill_viridis()； - 使用
theme(legend.position = )修改图例位置。
参考资料
[1]
GitHub - marco-meer/scifig_plot_examples_R: Scientific publication figure plotting examples with R: https://github.com/marco-meer/scifig_plot_examples_R
推荐： 可以保存以下照片，在b站扫该二维码，或者b站搜索【庄闪闪】观看Rmarkdown系列的视频教程。Rmarkdown视频新增两节视频（写轮眼幻灯片制作）需要视频内的文档，可在公众号回复【rmarkdown】
