总是有人在各个交流群提稀奇古怪的ngs组学技术怎么做这样的问题,是的,我没有给他写教程。但是这并不代表它没办法处理,因为我们的教程系列本质上也是看文献综述,看文档整理的。目前,在B站免费NGS数据处理视频课程并且已经组建了微信交流群的有下面这些:
- 免费视频课程《RNA-seq数据分析》
- 免费视频课程《WES数据分析》
- 免费视频课程《ChIP-seq数据分析》
- 免费视频课程《ATAC-seq数据分析》
- 肿瘤基因测序
如果这里面确实没有你需要的NGS技术,你需要做的仍然是看完我这些视频,搞清楚我是如何学习一个ngs技术的,然后把这个技能迁移到你自己的ngs数据。你会发现,万变不离其宗,本质上都是Linux能力,如何在服务器里面配置和管理软件,如何看各个软件说明书文档。
在成为生信工程师的道路上,克服Linux操作难关是必须滴,我把Linux的学习过程分成6个阶段 ,一般来说,每个阶段都需要至少一天以上的学习:
- 第1阶段:把linux系统玩得跟Windows或者MacOS那样的桌面操作系统一样顺畅,主要目的就是去可视化,熟悉黑白命令行界面,可以仅仅以键盘交互模式完成常规文件夹及文件管理工作。
- 第2阶段:做到文本文件的表格化处理,类似于以键盘交互模式完成Excel表格的排序、计数、筛选、去冗余,查找,切割,替换,合并,补齐,熟练掌握awk,sed,grep这文本处理的三驾马车。
- 第3阶段:元字符,通配符及shell中的各种扩展,从此linux操作不在神秘!
- 第4阶段:高级目录管理:软硬链接,绝对路径和相对路径,环境变量
- 第5阶段:任务提交及批处理,脚本编写解放你的双手
- 第6阶段:软件安装及conda管理,让linux系统实用性放飞自我
无论什么样的教程和视频,都只能是引导和方便你学习,加速你的进步,不可能替代你自己的努力。
但是,如果你没有服务器,这里有一个简单的解决方案,见:什么,你连10块钱的云服务器都不想买。足够练习Linux技巧了,但是如果需要安装软件和熟悉conda操作,仍然是建议有一个自己的服务器,也超级实惠目前。见:让你购买云服务器学Linux你居然给我安装了一个Windows,购置了一个腾讯云轻量应用服务器(一年40-74元),方便自己日常练习Linux。
活动仅限于还没有在腾讯云购买过服务器的新手,活动如下所示:
这样的配置,足够做绝大部分Linux命令的练习啦,甚至可以开通自己的博客,因为你其实是拥有了一个公网IP哦,还等什么呢, 赶快扫描购买吧!
如果能购买一本书籍就最好不过了:
自行掌握Linux基本技能,我们有公开课(扫描即可直达B站学习!):
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