MCU指的是微控制器，MPU指的是微处理器。
MCU集合了FLASH、RAM和一些外围器件。MPU的FLASH和RAM则需要设计者自行搭建，当然MCU也可以外扩。MPU的电路设计相对MCU较为复杂。
MCU一般使用片内FLASH来存储和执行程序代码，MPU将代码存储在外部FLASH中，上电后将代码搬运至RAM中运行。因此MCU的启动速度更快。MCU虽然也可以将代码运行在RAM中，但是内部RAM容量小，使用外部扩展RAM的话速度相对内部也较慢。MPU的主频相对较高，外接的内存也一般是DDR3,DDR4这种速度比较快的，适用于运算比较复杂的。
MCU不具备内存管理单元（MMU），不能运行Linux这种操作系统，只能运行小型操作系统，因此无法运行多进程这种程序。小型操作系统的RTOS多任务类似于多线程。
MCU相对MPU具有更强的实时性。
MCU相对MPU具有更低的功耗。虽然MPU也有低功耗模式，但不会像MCU那么低。
至于如何选择，是使用MCU还是MPU需要从性能要求，体积重量要求、预算成本等多方面综合考虑。一般地，MCU偏向于低成本低功耗，MPU趋向于高性能。目前的MCU和MPU的界限在逐渐模糊，MCU的主频也在不断提高，外设不断增加。在远程控制，消费电子或对实时要求高的场合使用MCU的多一些，在有大量计算，高速互联，或是图形交互要求高的地方使用MPU多一些。根据要求也可以使用MCU和MPU配合，现在好多芯片是同时具有MCU和MPU的多核，更方便设计者使用。
