【Hadoop】如何做到Hadoop集群删库不跑路……

2022-05-17 15:40:01 浏览数 (1)

背景

扯个犊子先，我司进行集群迁移，没有用的测试机器要进行格式化卖掉了，然后突然一条伟大的命令，误删除了正在使用的hadoop集群所有节点的操作系统盘，数据盘保留，灾难就此来了。

HDFS集群重建和数据恢复

HDFS metadata以树状结构存储整个HDFS上的文件和目录，以及相应的权限、配额和副本因子（replication factor）等。nn启动的时候：会将磁盘上的元数据加载到内存中， 磁盘中的元数据只有：

1）抽象目录树 2）数据和块的对应关系， 3）没有 块的存储位置 磁盘上仅仅会存储一个空的节点列表，这个节点列表是在datanode发送心跳报告之后填上的。例如：/aa/hadoop2.7.6.tar.gz [blk237838365:[],blk237838366:[]] 而块的存储位置是在datanode向namenode发送心跳报告的时候汇报的，datanode向namenode汇报自己身上的块的存储信息。例如：hadoop01:blk237838365，blk237838366，blk237838367 然后内存接收datanode的心跳包 ，补全块的存储位置列表整。例如：/aa/hadoop2.7.6.tar.gz [blk237838365:[hadoop01,hadoop02],blk_237838366:[hadoop01]]

NameNode

HDFS metadata主要存储两种类型的文件

  • fsimage

记录某一永久性检查点（Checkpoint）时整个HDFS的元信息

  • edits

所有对HDFS的写操作都会记录在此文件中

  • Checkpoint介绍

standbynamenode HDFS会定期（dfs.namenode.checkpoint.period，默认3600秒）的对最近的fsimage和一批新edits文件进行Checkpoint（也可以手工命令方式），Checkpoint发生后会将前一次Checkpoint后的所有edits文件合并到新的fsimage中，HDFS会保存最近两次checkpoint的fsimage。Namenode启动时会把最新的fsimage加载到内存中。

基础知识加强

1.namenode节点

cat /export/hadoop/hdfs/namenode/current/VERSION

代码语言：javascript复制
namespaceID=1242163293
clusterID=CID-124668a8-9b25-4ca7-97bf-5dd5c25041a9
cTime=1455091012961
storageType=NAME_NODE
blockpoolID=BP-180412957-40.32.10.18-1419305031110
layoutVersion=-60
  • layoutVersion

HDFS metadata版本号，通常只有HDFS增加新特性时才会更新这个版本号

  • namespaceID/clusterID/blockpoolID

这三个ID在整个HDFS集群全局唯一，作用是引导Datanode加入同一个集群。在HDFS Federation机制下，会有多个Namenode，所以不同Namenode直接namespaceID是不同的，分别管理一组blockpoolID，但是整个集群中，clusterID是唯一的，每次format namenode会生成一个新的，也可以使用clusterid手工指定ID。

  • storageType

有两种取值NAMENODE /JOURNALNODE，对于JournalNode的参数dfs.journalnode.edits.dir，其下的VERSION文件显示的是JOURNAL_NODE。

  • cTime

HDFS创建时间，在升级后会更新该值。

2.edits_start transaction ID-end transaction ID

finalized edit log segments，在HA环境中，Standby Namenode只能读取finalized log segments

3.edits_inprogress_start transaction ID

当前正在被追加的edit log，HDFS默认会为该文件提前申请1MB doublebuffer空间以提升性能

4.fsimage_end transaction ID

每次checkpoing（合并所有edits到一个fsimage的过程）产生的最终的fsimage，同时会生成一个.md5的文件用来对文件做完整性校验

5.seen_txid

保存最近一次fsimage或者edits inprogress的transaction ID。需要注意的是，这并不是Namenode当前最新的transaction ID，该文件只有在checkpoing(merge of edits into a fsimage)或者edit log roll(finalization of current edits inprogress and creation of a new one)时才会被更新。这个文件的目的在于判断在Namenode启动过程中是否有丢失的edits，由于edits和fsimage可以配置在不同目录，如果edits目录被意外删除了，最近一次checkpoint后的所有edits也就丢失了，导致Namenode状态并不是最新的，为了防止这种情况发生，Namenode启动时会检查seen_txid，如果无法加载到最新的transactions，Namenode进程将不会完成启动以保护数据一致性。

6.in_use.lock

防止一台机器同时启动多个Namenode进程导致目录数据不一致

HDFS集群重建步骤

前提是从last found找回了元数据!!! lost found目录的文件通常是未链接的文件（名字以及被删除），这些文件还被一些进程使用（数据没有删除），在系统突然关机时（内核panic或突然断电）出现。这些文件系统会删除的，你不需要担心。当因为软件或硬件出现错误，导致文件系统不一致，也有可能把有问题的文件放入到lost found目录。它提供了恢复丢失文件的一种方法。

操作

1.看运维大佬能不能恢复磁盘。

2.查看NN和JN下面是不是还有没有删干净的，注意lost found下面也是可以用的。

3.重建集群指定dfs.namenode.name.dir，dfs.journalnode.edits.dir，dfs.namenode.data.dir配置要和故障集群一致，启动新建集群，只启动NN和JN，DN不启动，观察是否可以正常启动。

4.同步故障集群Blockpool ID，Namespace ID，Cluster ID 到新建集群两个namenode节点，同步点name node /export/hadoop/hdfs/namenode/current/VERSION journal node /export/hadoop/hdfs/journal/xcardata/current/VERSION fsimage，edits，seen_txid 同步两个nn一致 因为是拷贝数据节点的VERSION，所以datanode不需要修改。如果集群没有启用Federation机制，那么Blockpool ID，Namespace ID，Cluster ID全部一致，如果启用Federation机制Blockpool ID，Namespace ID会有2套，当前集群是没有启用。

Federation是指HDFS集群可使用多个独立的NameSpace(NameNode节点管理)来满足HDFS命名空间的水平扩展,【单机namenode的瓶颈大约是在4000台集群，而后则需要使用联邦机制】 这时候在DataNode上就不仅仅存储一个Block Pool下的数据了,而是多个(大家可以在DataNode的datadir所在目录里面查看BP-xx.xx.xx.xx打头的目录).

5.重启新集群，等待nn启动加载fsimage和edit_image元数据和dn的block位置上报。

6.观察监控发现。

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under replicated blocks 100w 副本数小于指定副本数的block数量
block with corrupted replication 108w 损坏块个数

解决步骤

1.退出安全模式

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hadoop dfsadmin -safemode leave

2.列出损坏文件，损坏的文件无法恢复，只能删除

代码语言：javascript复制
hdfs fsck /

3.只删除有问题的块文件，delete corrupted files

代码语言：javascript复制
hdfs fsck -delete

补充

  • 定位有问题块
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hdfs fsck / | egrep -v '^. $' | grep -v replica | grep -v Replica
  • 打印出来块位置信息
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hdfs fsck /path/to/corrupt/file -locations -blocks -files
  • 删除问题块
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hdfs fs -rm /path/to/file/with/permanently/missing/blocks
  • 查看元数据报告
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hadoop dfsadmin -metasave metasave-report.txt
  • 手动修复损坏的块数据 ，释放指定路径上的租约，路径必须位于HDFS文件系统上。默认重试次数为1。
  • lease recovery 的目的是当 Client 在写入过程中挂了后，经过一定的超时时间后，收回租约并关闭文件
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hdfs debug recoverLease -path/path/to/corrupt/file -retries 10

自动修复损坏的块数据 当数据块损坏后，DN节点执行directoryscan操作之前，都不会发现损坏；也就是directoryscan操作是间隔6h dfs.datanode.directoryscan.interval : 21600 在DN向NN进行blockreport前，都不会恢复数据块; blockreport操作是间隔6h dfs.blockreport.intervalMsec : 21600000 当NN收到blockreport才会进行恢复操作。

启动过程中遇到的问题

  • 问题一
代码语言：javascript复制
2020-10-16 01:17:27,500 INFO  impl.MetricsSystemImpl (MetricsSystemImpl.java:shutdown(606)) -
 NameNode metrics system shutdown complete. 2020-10-16 01:17:27,501 ERROR namenode.NameNode 
(NameNode.java:main(1783)) - Failed to start namenode. java.io.FileNotFoundException: 
/export/hadoop/hdfs/namenode/current/VERSION (Permission denied)         at
 java.io.RandomAccessFile.open0(Native Method)         at
java.io.RandomAccessFile.open(RandomAccessFile.java:316)     
datanode启动失败 Changing permission for /export4/hadoop/hdfs/data/ from 755 to 750

解决

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chown -R hdfs:hadoop /export[1-12]/hadoop/
  • 问题二

Blocks with no live replicas!=0 这意味着，有些块只有一个副本，就在当前节点上，如果数据节点被“删除”，则带有这些块的文件将被损坏。

解决

优雅的方法是通过一个使用来自-dfsadmin命令“metasave”。

代码语言：javascript复制
rm /tmp/single_replica
hdfs dfsadmin -metasave metasave-report.txt
cat /path/to/logs/hadoop/hdfs/metasave-report.txt | grep "l: 1" | cut -d':' -f1 >> /tmp/single_replica
for hdfsfile in `cat /tmp/single_replica`; do hadoop fs -setrep 3 $hdfsfile; done
设置副本数为3，依靠集群进行复制。
  • 问题三

报错 invalidate block

  • 情况1、在DataNode的块汇报以及增量块汇报操作时，NameNode会将汇报的数据块副本信息与当前NameNode内存中的数据块信息对比，然后计算出损坏的数据块副本，NameNode会调用BlockManager.markBlockAsCorrupt()方法处理损坏的副本
  • 情况2、客户端读文件以及DataNode的数据块扫描器都可能发现损坏的数据块副本，客户端会通过ClientProtocol.reportBadBlocks()方法向NameNode汇报损坏的数据块副本，DataNode会通过DatanodeProtocol.reportBadBlocks()方法向NameNode汇报损坏的数据块副本。

markBlockAsCorrupt()方法会将损坏的副本加入corruptReplicas队列中，然后判断该副本对应的数据块是否有足够的副本数量，如果数据块已经有足够的备份数量，则将调用invalidateBlock()方法直接将损坏的副本加入invalidateBlocks队列中进行删除操作。如果副本系数不足，则更新neededReplications队列，复制该数据块 使用invalidateBlock()方法删除副本的操作主要包括两个部分：①调用addToInvalidates()方法将数据块加入invalidateBlocks队列中，之后BlockManager会将这个副本的删除指令通过心跳响应发送给Datanode。②调用removeStoredBlock()从BlockManager.blocksMap中移除这个DataNode上的副本信息，同时更新excessReplicateMap、corruptReplicas以及neededReplications队列。 当触发NAMENODE的双活切换(active-namenode给zk的心跳超时会发生) Datanode增量汇报该block-datanode映射给 namenode（切换后的active namenode）的时候，edit log还没从JournalNode同步过来，这时在namenode中已经有了block-datanode映射（从刚才datanode的report中来），但是还没有block-file映射（从edits文件里面来），导致namenode认为这个块不属于任何文件，定义为该块为invalidate block。

这个在后台日志可以查到（后台standby没有完全变成activenamenode之前，会出现包含 invalidate block 的后台日志。） edits文件（包含block-file映射）:对于HDFS文件来说，包含的信息有修改时间、访问时间、块大小和组成一个文件块信息等；而对于目录来说，包含的信息主要有修改时间、访问控制权限等信息

解决

重新上报block信息

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hdfs dfsadmin -triggerBlockReport datanode_ip:port

注意

  • 如果元数据完全丢失，datanode没有存储数据和块的关联信息，所以集群数据无法恢复
  • 经此一役，一定要做好元数据备份，所以定期及时的备份fsimage、edits和seen_txid文件非常重要（建议直接备份current整个目录）！即使存在HA的架构建议也备份下，多一份备份多一分安全。
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