CompactPCI与传统工业PC相对比，有很大的优势。
1、易维护性
从传统工业PC系统上更换一块板卡常常是相当耗时的；用户需松开并移去机箱盖。由于板卡与外围设备之间可能会有一些内部连接电缆。而换卡时必须将这些连线断开，因此这一过程是很容易出错的。Compact PCI 设计可以从前面板拔插板卡。 更换 Compact PCI 板卡非常简单， 无需拆下机箱盖，因此更换板卡非常快捷简便。维修时间将会从小时级（传统工业PC）缩减为分钟级，从而缩短了MTTR（平均维修时间）。
2、抗震性
传统工业PC不能对系统中的外围设备板卡提供可靠而安全的支持，插与其中的板卡只能固定于一点。卡的顶端和底部也没有导轨支持，因此卡与槽的连接处也容易在震动中 接触不良。 Compact PCI卡牢牢地固定在机箱上，顶端和底部均有导轨支持。前面板紧固装置将前面板与周围的机架安全地固定在一起。卡与槽的连接部分通过针孔连接器紧密地连接（50kg力）。由于卡的四面均将其牢牢地固定在其位置上，因此即使在剧烈的冲击和震动场合，也能保证持久连接而不会接触不良。
3、通风性
传统的工业PC机箱内空气流动不畅，不能有效散热。空气流动因为无源底版、板卡支架和磁盘驱动器所阻塞。冷空气不能在所有板卡间循环流动，热空气也不能立即排出机箱外。电子设备和电路板会因这些冷却问题而损坏，使之变形，断线以及寿命短等。 Compact PCI系统为系统中所有发热板卡提供了顺畅的散热路径。冷空气可以随意在板 卡间流动，并将热量带走。集成在板卡底部的风扇系统也加速了散热进程。由于良好的机械设计带来通畅的散热途径，Compact PCI系统极少出现散热方面的问题。
4、支持热插拔
热插拔是一种在插卡或拔卡时对正在运行的系统没有任何影响的技术。Compact PCI热插拔技术采用导槽限位和长短针设计，使电源针与信号针精准对位并按通断电顺序进行严格时序控制，使所有主要部件可以在带电的情况下进行更换，缩短了维修/更换的平均时间，降低了维护难度。
5、空间设计弹性
Compact PCI的欧卡结构使得设计专用系统非常方便，例如可以在一个机箱中放多张CPU卡，通过背板进行网络“硬”连接，组成多冗余系统；在空槽位置加装系统调理模块或航空专用插头等。
6、CompactPCI与PXI电气兼容
PXI (PCI extensions for Instrumentation，面向仪器系统的PCI扩展) 是基于PC的测量和自动化平台，将台式PC的性能价格比优势与PCI总线面向仪器领域的必要扩展完美地结合起来，形成一种主流的虚拟仪器测试平台。PXI在CompactPCI 的J2增加了时钟同步、星形触发等信号，其余与CompactPCI完全电气兼容，因此当不需要多主机多卡同步的系统中，PXI板卡插在PXI或CompactPCI机箱上的功能是相同的，。
