2021 12/16基因日签
真核生物的转录调控-小结
第28章 真核生物的转录调控
转录因子包括基础转录因子、激活因子和辅激活因子。基础转录因子与RNA聚合酶在起始点相互作用。激活因子与定位于启动子附近或增强子中的特异性短小DNA序列相互作用。激活因子与基础转录装置以蛋白质-蛋白质相互作用的形式产生效应，一些激活因子与基础转录装置可直接作用，而其他则需要辅激活因子介导这种相互作用。
RNA聚合酶Ⅱ的启动子附近拥有许多短顺式作用元件，其中一些能被反式作用因子所识别。顺式作用元件位于TATA框的上游，它可以任意取向存在，也可存在于离起始点不同的距离，或定位于下游的内含子区域内。
根据其序列同源性已经鉴定出了几组转录因子。同源异形域是一个由60个氨基酸残基组成的序列，可调节昆虫、蠕虫和人类中的发育。它与原核生物的螺旋-转角-螺旋基序相关，并为这些转录因子提供了结合DNA的基序。
参与DNA结合的另一个基序是锌指结构，它是在那些能结合DNA或RNA（有时两者同时）的蛋白质中发现的。
亮氨酸拉链含有一个富含亮氨酸残基的氨基酸序列，它在转录因子的二聚体化中起作用；而在bZIP转录因子中，与之相邻的碱性区负责与DNA结合。
类固醇受体是这一转录因子群体中最早被认识的成员，它是通过结合一种小的疏水性激素而活化的，活性因子接着在细胞核中定位，并结合到特异应答元件上，然后激活转录。
HLH（螺旋-环-螺旋）蛋白含有两亲性螺旋，负责二聚体化作用，与结合DNA的碱性区相连。bHLH蛋白有一个结合DNA的碱性区，它分为两组：广谱表达的bHLH蛋白和组织特异性的bHLH蛋白。
许多转录因子以二聚体形式行使功能。家族内许多成员构成同源和异源二聚体，这是很常见的，也为各种复杂组合影响基因表达提供了潜力。
调控区位于核小体的基因通常不被表达。
通过涉及ATP水解的一种机制，染色质重塑复合体能够滑动或置换组蛋白八聚体。染色质重塑复合体的大小范围不等，它可以根据ATP酶亚基而进行分类，常见类型是SWI/SNF、ISWI、CHD和INO90/SWRI。
过度的共价修饰发生在组蛋白尾部，而所有这些事件都是可逆的。
大的激活或阻遏复合体常常含有几种可执行不同染色质修饰的活性。
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