追热点文献挖到忍不住想分享的单细胞数据库...

2022-04-01 15:34:17 浏览数 (2)

作为一枚喜欢追(蹭)热点的小编,刷热点文献是常规操作,原本以为看研究类paper只能分享点研究思路、数据资源...没想到挖到一个单细胞数据 实验流程/分析流程 文献的综合平台:descartes.brotmanbaty.org。

背靠背发表在Science的两篇文章中

都出现了这个平台

Cao J, O’Day D R, Pliner H A, et al. A human cell atlas of fetal gene expression[J]. Science, 2020, 370(6518).

Domcke S, Hill A J, Daza R M, et al. A human cell atlas of fetal chromatin accessibility[J]. Science, 2020, 370(6518).

打开网站是这个样纸

descartes.brotmanbaty.org

用户可以通过此平台,“一键”获取每项单细胞研究的数据资源、实验流程(或分析流程)和文献信息,其中部分研究还提供了数据分析的可视化结果。

举个例子,来看看它的功能吧

每项研究都有简要的标题以及数据量信息。

数据可视化

点击Atlas,进入数据详情页,通过选择不同组织查看细胞类型组成、基因表达情况、降维分析及其他统计结果等。

下载数据

点击Atlas,进入数据详情页,在“Download”部分可以下载原始基因计数矩阵、抽样数据、元数据、差异表达基因列表、基因表达矩阵、已处理的数据集等。

获取实验流程

点击Atlas,进入数据详情页,点击“Protocol”即可获取完整的实验流程信息。

获取相关文献信息

首页直接点击“Publication”,或数据详情页点击“Paper”,即可直链相关研究文献。

图片来源于Science官网和descartes.brotmanbaty.org,如有侵权请联系删除。

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