高颜值在线绘图平台ImageGP系列教程 - 参数介绍

1.2 每个工具基本介绍

以热图为例，介绍下各个工具页面的组成部分。

第一部分是轮播图，展现每个工具能产生的代表性图、示例数据和参数；给定符合格式的数据、设置指定的参数，即可获得右侧的可视化结果。

第二部分是引用信息。BIC 目前还是 Beta 版，尚未发表，其前身 ImageGP 已发表到 iMeta (https://doi.org/10.1002/imt2.5) 杂志，使用后请引用，支持工具的进一步发展。

第三部分是 Demo 按钮。通常 Demo 按钮的数目和顺序是跟轮播图一致的，点击 Demo 按钮后，会填入相应的数据、选择相应的参数，直接点击提交就可以获得可视化结果。

第四部分是 Input data参数。支持直接粘贴矩阵到对应的文本框 （不需要注册）或先注册后上传文件再选择已上传的文件 （适合数据比较大，直接粘贴进来会把浏览器卡住的情形；或者多个工具都会用到的数据，上传一次多次使用）。

第五部分是 更多参数如 Cluster parameters, Data preprocess, Layout等。每个手风琴里面有更多参数可以设置，如果该手风琴里面有必选参数，通常是打开的；如果没有必选参数，默认是收起的。工具为了灵活性供更多人使用，参数比较多，但不是每次分析都会用到这么多参数，常用的只有少部分。

第六部分是 Submit，提交。等待出结果。

第七部分是结果显示，PNG 图，PDF 图，绘图脚本，其它辅助数据。单纯可视化的工具显示简单，分析的工具显示复杂。

1.3 参数的控制

1. 参数前面如果有一个红色的星号 (*)表示是必选或必填参数。如果必选或必填参数为空，则不能提交；或提交时也会弹出信息，不允许提交。
2. 参数后面都有一个符号 (i)，鼠标放上去后会悬浮显示这个参数的解释。这是了解这个参数的关键信息。
3. 凡是有改动的参数，都会添加黄色背景以示区别。比如点击 Demo后，会看的一些参数飘黄了，不要害怕，只是提示你 Demo 对这些参数做了修改。

1. 参数的智能控制：
   1. 点击Check data之前，所有下方参数都不可用。需要先确保数据格式无误、Check data 通过后，才可以选择更多参数。
   2. 点击Check data后，也会存在部分参数不可用的情况。这是因为参数之间存在着级联控制。如热图聚类，如果没有选要做聚类、则聚类方法、距离计算方法不可选，选了也没用。看到一个参数不可用，如果不知道是做啥的或用不到，就可以大胆的忽略。如果想用，却发现用不了，就要找下其相关参数有没有设置。
   3. 部分参数为下拉，主要是选择数据矩阵中的列名字、列的内容时会用到。这样一来可以避免输入错误，二来也给了一个提示这个参数应该提供什么信息。
   4. 颜色参数之间存在互斥。选择颜色集合和自定义取色两个只有一个处于可选状态，清空一个选项，另一个选项即可用。

1.4 数据格式效验

数据格式效验主要包括几个内容：

1. 数据矩阵的列分割符是否为单个TAB键。
2. 数据矩阵的每一行列数是否相等。这也是常见问题。
3. 矩阵的列名字是否有特殊字符。
4. 两个数据矩阵的信息是否匹配。
5. 宽矩阵是否第一列有无重复值、除了第一行和第一列其它元素是否都为数字。

检测不通过的都会给出提示，请仔细阅读提示信息，改正数据后再提交。