因为前面的Mac电脑键盘掉漆，而且tab键失灵，恰好新学期学生优惠开始了 ，就顺便换了个新Mac。配置环境后出现了超级诡异的事情，前前后后折腾了两三天，值得分享一下：
一般来说，拿到全新电脑，就按照我五年前写的生物信息学办公电脑环境配置教程安装好R和rstudio，以及对应的R包，详见：http://www.bio-info-trainee.com/3727.html
但是加载包的时候，出现了让我百思不得其解的报错情况，每次我都需要重新打开rstudio，然后加载 library(RTN)，你能看到下面有几种不同的报错吗？
代码语言：javascript复制*** recursive gc invocation
*** recursive gc invocation
*** recursive gc invocation
错误: package or namespace load failed for ‘RTN’ in is(fdef, "groupGenericFunction"):
找不到对象'object'
错误: package or namespace load failed for ‘RTN’ in assign(.sigLabel(sig), el, envir = table):
第一个参数不对
> library(RTN)
错误: package or namespace load failed for ‘RTN’ in .getGeneric(f, where, package):
'The argument "f" to getGeneric'必需是单一字符串(现在它是类别为"call"的对象)
*** recursive gc invocation
*** recursive gc invocation
*** recursive gc invocation
错误: package or namespace load failed for ‘RTN’ in namespaceImportFrom(self, asNamespace(ns), from = from, except = except):
'installTrChar' must be called on a CHARSXP, but got 'environment'
错误: package or namespace load failed for ‘Seurat’ in `parent.env<-`(`*tmp*`, value = if (!is.null(data$enclos)) data$enclos else emptyenv()):
参数不是环境
> R_system_version()
Error in .make_numeric_version(x, strict, .standard_regexps()$valid_R_system_version, :
起码是五种不同的报错提示，本来是准备去GitHub或者Stack Overflow求助的，先看了看自己的电脑环境：
代码语言：javascript复制> sessionInfo()
R version 4.1.1 (2021-08-10)
Platform: x86_64-apple-darwin17.0 (64-bit)
Running under: macOS Big Sur 11.5.2
Matrix products: default
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.1/Resources/lib/libRlapack.dylib
locale:
[1] zh_CN.UTF-8/zh_CN.UTF-8/zh_CN.UTF-8/C/zh_CN.UTF-8/zh_CN.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_4.1.1 minet_3.50.0 magrittr_2.0.1 limma_3.48.3 snow_0.4-4
[6] parallel_4.1.1 tools_4.1.1 igraph_1.2.7 RedeR_1.40.5 data.table_1.14.2
[11] pkgconfig_2.0.3
>
我留意到了两件事， 首先自己的Mac电脑并不是最新版系统，目前是macOS Big Sur 11.5.2 ，而最新版是：macOS Monterey ，其它一些版本如下所示：
macOS | 最新版本 |
|---|---|
macOS Monterey | 12.0.1 |
macOS Big Sur | 11.6.1 |
macOS Catalina | 10.15.7 |
macOS Mojave | 10.14.6 |
参考：https://support.apple.com/zh-cn/HT201260
想着是不是新买的电脑，但是操作系统没有跟上时代，就花了两个多小时更新了系统，尴尬的是升级到了最新版，仍然是不能解决前面的加载同样的包每次报错还不一样的郁闷。
这个时候，灵感来了，我去原始的R里面加载同样的包，居然就不会报错，让我彻底明白了，所谓的报错，居然是Rstudio这个工具的问题！但是我明明是在官网下载的最新版啊：https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
官网的最新版Rstudio
这个时候，跟朋友们交流了一下， 发现大家的rstudio并不是目前官网显示的日期这样的标记，而是 普通的版本号，比如：RStudio-1.4.1717.dmg
所以我去下载了旧版本的rstudio，果然，这次就没有了前面的奇奇怪怪的报错。
但我其实并不能理解其中的问题产生的原因，仅仅是使用控制变量法的思维去解决了这些报错罢了。
