计算 Python 代码的内存和模型显存消耗的小技巧

2021-12-21 18:49:01 浏览数 (1)

了解Python代码的内存消耗是每一个开发人员都必须要解决的问题，这个问题不仅在我们使用pandas读取和处理CSV文件的时候非常重要，在我们使用GPU训练的时候还需要规划GPU的显存使用。尤其是我们在白嫖使用kaggle和colab时显得更为重要。

本篇文章我们将介绍两个 Python 库 memory_profiler和Pytorch-Memory-Utils，这两个库可以帮助我们了解内存和显存的消耗。

memory_profiler

代码语言：javascript复制
pip install memory_profiler#Load its magic function
%load_ext memory_profiler
from memory_profiler import profile

memory_profiler可以完成以下的工作：

1、查找一行的内存消耗

我们只需要在代码的前面加上魔法函数 %memit

代码语言：javascript复制
%memit x = 10 5
#Output
peak memory: 54.01 MiB, increment: 0.27 MiB

这里，峰值内存（peak memory）是运行此代码的进程消耗的内存。增量只是由于添加这行代码而需要/消耗的内存。同样的逻辑也适用于以下其他的显示。

2、查找函数的内存消耗

在调用函数的行的开头添加魔法函数。

代码语言：javascript复制
def addition():
    a = [1] * (10 ** 1)
    b = [2] * (3 * 10 ** 2)
    sum = a b
    return sum

%memit addition()
#Output
peak memory: 36.36 MiB, increment: 0.01 MiB

3、逐行查找函数的内存消耗

如果需要记录函数中每一行的内存使用，我们可以使用@profile 装饰器。但是@profile 仅适用于在单独模块中定义的函数，因此我们将首先使用 %%file 创建一个名为 demo.py 的简单模块，其中包含我们的函数

代码语言：javascript复制
%%file demo.py
from memory_profiler import profile

@profile
def addition():
    a = [1] * (10 ** 1)
    b = [2] * (3 * 10 ** 2)
    sum = a b
    return sum

现在，我们可以调用该函数

代码语言：javascript复制
from demo import addition

%memit addition()

#Output
Line #    Mem usage    Increment   Line Contents
================================================
     2     36.4 MiB     36.4 MiB   @profile
     3                             def addition():
     4     36.4 MiB      0.0 MiB       a = [1] * (10 ** 1)
     5   3851.1 MiB   3814.7 MiB       b = [2] * (3 * 10 ** 2)
     6   7665.9 MiB   3814.8 MiB       sum = a b
     7   7665.9 MiB      0.0 MiB       return sum
peak memory: 7665.88 MiB, increment: 7629.52 MiB

4、完整python脚本的内存消耗

这个这个方法不能再 notebook 中使用。我们必须创建 python 脚本并通过命令行运行它。

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#create script.py
import time

@profile
def function1():
    n = 100000
    a = [1] * n
    time.sleep(1)
    return a
    
@profile
def function2():
    n = 200000
    b = [1] * n
    time.sleep(1)
    return b

if __name__ == "__main__":
    function1()
    function2()

之后运行脚本并查看

代码语言：javascript复制
#On command line
mprof run script.py
#To generate plot 
mprof plot

我们可以看到内存消耗与时间的关系图

@profile装饰器没有必要放在函数前面，如果我们不保留它，我们不会看到函数级内存消耗，但我们会看到整个脚本的内存消耗

Pytorch-Memory-Utils

通过Pytorch-Memory-Utils工具，我们在使用显存的代码中间插入检测函数，这样就可以输出在当前行代码时所占用的显存。这个对于我们计算模型的GPU显存占用是非常方便的，通过计算显存占用，我们才能够最大化训练的batch size，保证训练的最优速度。

代码语言：javascript复制
import torch
import inspect

from torchvision import models
from gpu_mem_track import MemTracker  # 引用显存跟踪代码

device = torch.device('cuda:0')

frame = inspect.currentframe()     
gpu_tracker = MemTracker(frame)      # 创建显存检测对象

gpu_tracker.track()                  # 开始检测
cnn = models.vgg19(pretrained=True).to(device)  # 导入VGG19模型并且将数据转到显存中
gpu_tracker.track()

然后可以发现程序运行过程中的显存变化（第一行是载入前的显存，最后一行是载入后的显存）：

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At __main__ <module>: line 13                        Total Used Memory:472.2  Mb

  | 1 * Size:(128, 64, 3, 3)      | Memory: 0.2949 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 1 * Size:(256, 128, 3, 3)     | Memory: 1.1796 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 1 * Size:(64, 64, 3, 3)       | Memory: 0.1474 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 2 * Size:(4096,)              | Memory: 0.0327 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 1 * Size:(512, 256, 3, 3)     | Memory: 4.7185 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 2 * Size:(128,)               | Memory: 0.0010 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 1 * Size:(1000, 4096)         | Memory: 16.384 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 6 * Size:(512,)               | Memory: 0.0122 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 1 * Size:(64, 3, 3, 3)        | Memory: 0.0069 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 1 * Size:(4096, 25088)        | Memory: 411.04 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 1 * Size:(4096, 4096)         | Memory: 67.108 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 5 * Size:(512, 512, 3, 3)     | Memory: 47.185 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 2 * Size:(64,)                | Memory: 0.0005 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 3 * Size:(256,)               | Memory: 0.0030 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 1 * Size:(128, 128, 3, 3)     | Memory: 0.5898 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 2 * Size:(256, 256, 3, 3)     | Memory: 4.7185 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>
  | 1 * Size:(1000,)              | Memory: 0.004 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'>

At __main__ <module>: line 15                        Total Used Memory:1387.5 Mb

通过上面的报告，很容易发现一个问题。

首先我们知道VGG19所有层的权重大小加起来大约是548M(这个数值来源于Pytorch官方提供的VGG19权重文件大小)，我们将上面报告打印的Tensor-Memory也都加起来算下来也差不多551.8Mb。但是，我们算了两次打印的显存实际占用中：1387.5 – 472.2 = 915.3 MB。

Pytorch在开始运行程序时需要额外的显存开销，这种额外的显存开销与我们实际使用的模型权重显存大小无关。 这个额外的显存Pytorch的开发者也对此进行说明了，这部分释放后的显存可以用，只不过不在Nvidia-smi中显示，所以我们无需关注。

pytorch python

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