DAnIEL:真菌数据分析平台及相互作用关系数据库

2021-08-27 17:23:13 浏览数 (1)

网址:

https://sbi.hki-jena.de/daniel

DAnIEL是刚刚发表在Frontier上的真菌数据分析平台。

DAnIEL: a user-friendly web server for fungal ITS amplicon sequencing data Daniel Loos, Lu Zhang, Christine Beemelmanns, Oliver Kurzai, and Gianni Panagiotou Frontiers in Microbiology, doi:10.3389/fmicb.2021.720513

输入原始数据,可进行质控,得到ASV/OTU以及后续一些统计分析。

整个流程是把很多程序整合到了一起,可选的参数比较有限。

浏览了一下,发现左边knowledge base有两个数据库可能会更有用:

Interaction里面汇总了1669个真菌之间明确的相互作用关系。

Infections里收集了306个致病菌信息。

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