R语言ggplot2做箱线图的时候如何添加表示平均值的线

2021-10-13 11:49:20 浏览数 (1)

箱线图展示的就是分位数,中间的线表示的是中位数,也就是50%分位数,如果非要在箱线图上画上表示平均值的线段也是可以实现的,今天介绍一下实现代码

示例数据集我们用R语言的内置数据集PlantGrowth

image.png

首先是画一个最普通的箱线图

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df<-read.csv("PlantGrowth.csv")

library(ggplot2)
library(tidyverse)
p1<-ggplot(data=df,
       aes(x=group,y=weight)) 
  geom_boxplot(aes(fill=group))

p1

image.png

通过ggplot_build()函数可以获取画箱线图用到的数据

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ggplot_build(p1)$data[[1]]

image.png

我们利用原始数据计算一下平均值,然后将数据集的平均值添加到这组数据中

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df %>% 
  group_by(group) %>% 
  summarise(mean_value=mean(weight)) %>%
  rename("group_1"="group") %>% 
  cbind(ggplot_build(p1)$data[[1]]) -> df1

然后利用geom_segment()函数添加品均值的线段

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p1 
  geom_segment(data=df1,
               aes(x=xmin,xend=xmax,
                   y=mean_value,
                   yend=mean_value),
               color="red")

image.png

这里如果不想要中位数的线的话

找到一种办法是重新画一条线把原来的中位数的线给盖住

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p1 
  geom_segment(data=df1,
               aes(x=xmin,xend=xmax,
                   y=mean_value,
                   yend=mean_value),
               color="black",
               size=4) 
  geom_segment(data=df1,
               aes(x=xmin 0.005,xend=xmax,
                   y=middle,
                   yend=middle,
                   color=group_1),
               show.legend = F,
               size=5)

image.png

最后稍微美化一下

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ggplot(data=df,
       aes(x=group,y=weight)) 
  stat_boxplot(geom="errorbar",
               width=0.2) 
  geom_boxplot(aes(fill=group)) 
  geom_segment(data=df1,
               aes(x=xmin,xend=xmax,
                   y=mean_value,
                   yend=mean_value),
               color="black",
               size=4) 
  geom_segment(data=df1,
               aes(x=xmin 0.005,xend=xmax,
                   y=middle,
                   yend=middle,
                   color=group_1),
               show.legend = F,
               size=5) 
  theme_bw() 
  theme(legend.position = "top")

image.png

这个方法还是比较繁琐的,不知道有没有比较好的办法

(猜测geom_boxplot函数里应该是有一个步骤计算中位数的,试着看看源代码,看能不能把中位数的代码改为平均值)

还有一个问题是如果是分组的箱线图那么应该如何来实现呢?

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