PyMol-回答系列-特殊的氨基酸编号问题

2021-03-16 09:11:09 浏览数 (1)

有人后台问我两个蛋白

3nss以及5nwe

先看下图

169A?

没见过,我开始以为是突变

后来看了下源文件,里面有两个氨基酸一个是169 PRO(P),一个是169 TYR(Y)

没见过,问了一位老师。

回答是:解结构时套用了另外一个晶体,那个晶体没有169A的TYR

后来我又看了一下

可以看到的是两个结构,氨基酸的空间位置以及取向基本是一致的。

只是序号有区别。

所以,你可以把它当作一个特殊的氨基酸ID编号

或者就如上面所说的:

解结构时套用了另外一个晶体,那个晶体没有169A的TYR

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