文章复现-No.1-Rosetta-KIC-Part-9-rosetta-GeneralizedKIC 示例-2

2021-04-22 16:13:52 浏览数 (1)

前言

大概我也要慢慢的收费了,不过你们放心,我会分为两个部分,学术和商业。

就像广告,学术免费,商业收费。

教程呢,基础版也会写,就像前面的内容仍然是免费,但是后面的,一般情况下也用不到。用到的大多数可能是商业应用,所以,我会适当收费。

当然,收集来的资金,我会更新软件和硬件,尝试一些新的创新和想法,以后你们慢慢就知道了。

Tutorial by Vikram K. Mulligan (vmullig@uw.edu). Created on 28 March 2017 for the Baker lab Rosetta Tutorial Series. Updated 29 May 2017 for the new ref2015 default scorefunction.

提示:基本内容均在rosettabinlinux2021.07.61567bundle/main/demos/tutorials/GeneralizedKIC

文章复现-No.1-Rosetta-KIC-Part-9-rosetta-GeneralizedKIC 示例-2 前言 目标 使用GeneralizedKIC时的注意事项 练习 1: 建立一个多肽loop,并且闭合此loop,使用RosettaScripts 输入 Step 1:建立loop几何结构 Step 2:准备采样 Step 3: 设置 GeneralizedKIC Step 4: 设置loop段氨基酸以及选择pivots Step 5: 设置 GeneralizedKIC perturbers Step 6:过滤掉一些几何构象较差的solutions Step 7 : 最终的脚本 运行案例脚本 理想输出 总结 进阶阅读 附录 PBS脚本 输出文件图示 score.sc 全部结果图示

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