新手绘图一站式R包ggstatsplot

2021-07-06 14:44:53 浏览数 (1)

非常有意思的是,虽然我们介绍了海量的R语言绘图资源,包括手把手视频教学和配套书籍,以及海量的绘图参考代码。

但绝大部分小伙伴仍然是选择躺平,不愿意动手实战,提高自己。对这样的小白来说,各种拥有操作界面的软件可能是更适合,比如orgin和prism等等,其实R里面也有类似的骚操作,比如新手绘图一站式R包ggstatsplot,你就可以看成是一个商业化拥有操作界面的软件:

链接:https://indrajeetpatil.github.io/ggstatsplot/index.html

这个包的安装依赖于上百个包,所以我们通常建议初学者马上安装它,这样你的电脑里面的R语言的包就不是空白了。它内置的绘图函数并不多:

  • ggbetweenstats violin plots for comparisons between groups/conditions
  • ggwithinstats violin plots for comparisons within groups/conditions
  • gghistostats histograms for distribution about numeric variable
  • ggdotplotstats dot plots/charts for distribution about labeled numeric variable
  • ggscatterstats scatterplots for correlation between two variables
  • ggcorrmat correlation matrices for correlations between multiple variables
  • ggpiestats pie charts for categorical data
  • ggbarstats bar charts for categorical data
  • ggcoefstats dot-and-whisker plots for regression models and meta-analysis

但不得不说,颜值确实是杠杠的,信息量也非常丰富,比如一个普通的箱线图:

ggbetweenstats

可以看到,仅仅是需要调用 ggbetweenstats 函数即可,图里面的统计学元素超级丰富!这也是它的特色,统计学函数也超级多。

更多高颜值函数大家可以自行阅读文档:https://indrajeetpatil.github.io/ggstatsplot/index.html

另外一个很常见的散点图也被美化的不要不要的:

其实它的底层仍然是ggplot系列

但是如果你要从ggplot2开始一步步调制成为它这样的美图,需要的功力很深。

一张统计图就是从数据到几何对象(点、线、条形等)的图形属性(颜色、形状、大小等)的一个映射。

  • ✦ 数据(Data),最基础的是可视化的数据和一系列图形映射(aesthetic mappings),该映射描述了数据中的变量如何映射到可见的图形属性。
  • ✦ 几何对象(Geometric objects, geoms)代表在图中实际看到的点、线、多边形等。
  • ✦ 统计转换(Statistical trassformations, stats)是对数据进行某种汇总,例如将数据分组创建直方图,或将一个二维的关系用线性模型进行解释。
  • ✦ 标度(Scales)是将数据的取值映射到图形空间,例如用颜色、大小或形状来表示不同的取值,展现标度的常见做法是绘制图例和坐标轴。
  • ✦ 坐标系(Coordinate system, coord)描述数据是如何映射到图形所在的平面,同时提供看图所需的坐标轴和网格线。
  • ✦ 分面(faceting)如何将数据分解为子集,以及如何对子集作图并展示。
  • ✦ 主题(theme)控制细节显示,例如字体大小和图形的背景色。

另外推荐5个ggplot2资源

ggplot2作者亲自写的书

链接:https://ggplot2-book.org/facet.html

书名是:ggplot2: Elegant Graphics for Data Analysis 作者:Hadley Wickham

This is the online version of work-in-progress 3rd edition of “ggplot2: elegant graphics for data analysis”

虽然这本书有对应的中文译本,但是时间上相对滞后,建议直接看这个在线实时更新版本。

知识点参考卡片(速记表,小抄)

链接:https://ggplot2.tidyverse.org/reference/

sthda网站的ggplot核心图表示例

链接:http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-essentials

书籍本身提供售卖,价格是17欧元,不过内容都是电子化了,大家直接网页浏览,就是免费的哈!

绘图菜谱

链接:http://www.cookbook-r.com/Graphs/

这个有中文翻译版本,务必直接下单购买,放在书桌旁边随时翻阅。

最后一个是 https://stackoverflow.com/

你会发现,你想实现的各种稀奇古怪的绘图需求,只需要你能使用英文描述出来,就是能找到答案的!

  • 用谷歌搜索来使用ggplot2做可视化(上):https://mp.weixin.qq.com/s/WN4TSMNjH4b6vZgYVjaRvQ
  • 用谷歌搜索来使用ggplot2做可视化(下):https://mp.weixin.qq.com/s/_Q16zDZgCr3XoO0r3wqRkw

如果我说,全部学完,需要一年的时间,不知道你还是否愿意入坑呢?

不过,如果你是R语言都没有掌握好,那么可能需要先学习我给初学者的六步系统入门R语言,知识点路线图如下:

  • 了解常量和变量概念
  • 加减乘除等运算(计算器)
  • 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子)
  • 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表)
  • 文件读取和写出
  • 简单统计可视化
  • 无限量函数学习

参考:《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)

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