我们在R语言授课时候最希望传达的一个代码组织习惯就是不同步骤在不同文件夹,而且每个文件夹里面都需要一个Rproject文件,这样鼠标双击就可以打开你的rstudio软件,而且同步定位到当前文件夹作为你的工作目录。
每个文件夹里面都需要一个Rproject文件
代码和数据都在同一个文件夹下面,组织的明明白白!
但是这个Rproject文件需要首先打开 rstudio软件 ,然后新建Rproject,这样就会很麻烦,因为没有办法直接右键新建它。所以我视频通常是演示从其它地方拷贝这样的Rproject文件即可,因为它其实是多个文件夹多个项目通用的。
最近咱们《生信技能树》学习者交流群的宝藏男孩,永和,推荐了一个好用的软件,ContextMenuManager 帮助你右键新建一个Rproject文件。
ContextMenuManager 帮助你右键新建一个Rproject文件
挺好用的,小技巧送给大家哈!
再怎么强调生物信息学数据分析学习过程的计算机基础知识的打磨都不为过,我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化,以及基于Linux的NGS数据处理:
- 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》
- 《生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)》
把R的知识点路线图搞定,如下:
- 了解常量和变量概念
- 加减乘除等运算(计算器)
- 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子)
- 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表)
- 文件读取和写出
- 简单统计可视化
- 无限量函数学习