第一个 跟着Nature Communications学画图 系列 完结。涉及到的内容包括，基础绘图函数画散点图、基础绘图函数画箱线图、基础绘图函数拼图、ggplot2画散点图分组添加拟合曲线、ggplot2画图拼图、ggplot2画箱线图。
这些内容都来自 Nature Communications 的论文 Fecal pollution can explain antibiotic resistance gene abundances in anthropogenically impacted environments
这篇论文数据分析和可视化的部分用到的数据和代码全部放到了github上 https://github.com/karkman/crassphage_project
非常好的R语言学习素材。
今天将以上内容做一个合集，方便大家查看。
R语言基础绘图函数散点图~跟着Nature Communications学画图~Figure1
跟着Nature Communications学画图~Figure1~ggplot2箱线图
跟着Nature Communications 学画图~ggplot2散点图分组添加拟合曲线
跟着Nature Communications 学画图~ggplot2拼图
跟着Nature Communications 学画图~ggplot2画箱线图
基础绘图函数拼图是一个视频教程
我又找到了一篇Nature Communications 的论文，它用到的代码全都放到了附件里。数据也可以在网上下载。虽然暂时还看不太懂论文的具体研究内容。但是对于我们学习R语言作图来说却是非常好的学习素材。后面的推文会陆续介绍一下这篇论文中的图片的实现代码。下面是论文中的一些截图
image.png
image.png
image.png
image.png
这篇论文的题目是 Combining gene mutation with gene expression data improves outcome prediction in myelodysplastic syndromes下载链接 https://www.nature.com/articles/ncomms6901 接下来的推文会陆续介绍以上截图中的图片的R语言实现过程。
下载论文和论文的附件大家可以试一下bget这个工具，我也录了一期视频进行介绍。但是我使用的时候遇到的问题是只有Nature Communications的论文附件可以完整下载。其他期刊的都会遇到报错，暂时不知道是什么原因。
