ggrepel解决标签之间重叠问题

有时候画图需要给样本添加标签，当样本比较多，在图形中添加标签容易出现标签遮盖的问题，这个时候可以用ggrepel包的geom_text_repel()解决样本标签重叠问题。 当用geom_text()添加标签时会出现重叠现象：

代码语言：javascript复制

ggplot(mtcars)  geom_point(aes(wt, mpg), color="blue")  
  geom_text(aes(wt, mpg, label=rownames(mtcars)))  
  theme_classic(base_size = 16)

用geom_text_repel()代替geom_text()时则不会重叠：

代码语言：javascript复制

library(ggrepel)
ggplot(mtcars)  geom_point(aes(wt, mpg), color="blue")  
  geom_text_repel(aes(wt, mpg, label=rownames(mtcars))) 
  theme_classic(base_size = 16)

在用seurat分析单细胞数据时也常出现标签覆盖问题， 可以通过设置repel = TRUE来解决。

代码语言：javascript复制

DimPlot(brain.integrated, reduction = "umap", group.by = "orig.ident", label = TRUE)   NoLegend()

代码语言：javascript复制

DimPlot(brain.integrated, reduction = "umap", group.by = "orig.ident", label = TRUE, repel = TRUE)   NoLegend() 

text 数据

0 人点赞