聊点学术
Western Blot实验有非常多的注意事项,只要把细节控制好就能得到漂亮的图。
早期我专门总结了相关注意事项,建议阅读本文之前先回顾下面3篇文章:
【全程剖析Western blot原理,你才能掌控它。】
【血泪教训,Western blot最全避雷手册。】
【干货 ▎Image J分析Western Blot蛋白条带灰度值】
Western Blot实验的最后环节是查看曝光后的蛋白条带图,在蛋白表达丰度很高或很低,用肉眼很难评价蛋白条带是否过曝或曝光不足。
(图片来自网络)
为什么要如此强调曝光程度呢?
蛋白条带半定量分析的本质是在0-255范围内定量检测条带的灰度值。
(1)如果曝光时间足够长,所有组别的条带灰度值都会趋近255(不会超过255)。如此一来,组间灰度值的差异可能因为曝光时间过久而被人为灭失,也就是假阴性。
(2)如果曝光时间太短,荧光未充分发出,此时组间的差异可能并非真实情况,而是曝光度不足形成的,条带变成什么样都有可能,灰度值也是不可信的,也就是假阳性。
最好的蛋白条带是在合适的曝光条件下获得的。这个合适就很耐人寻味了!
为了拿到准确的实验结果或及时调整实验条件(如抗体浓度、曝光时间等),很有必要对蛋白条带曝光程度进行分析。
只需半分钟即可做到!
图文步骤
1.打开Image Pro Plus,打开一张曝光后的蛋白条带灰度图。
2.点击measure,选择Line Profile。
3.在弹窗中按照如下设置,共4个要点。
4.此时,条带图中会出现两条平行线。将线条拉长,使得平行线夹住目标条带。
5.此时,再来看右侧的波形图。
波形分析:
纵坐标轴最高为250(灰度值上限为255)。可以看到所有波峰(即目标条带)都超过了200,较多条带灰度值逼近250;所有波谷均在150以上,说明条带背景也稍强。
这种情况下,说明条带曝光时间稍长。如果再次进行WB实验,在其它条件不变的情况下,需要适当减短曝光时间。
大致原理如此,希望各位实验顺利。
Ending