ggplot2_总纲

2020-09-15 15:40:32 浏览数 (1)

ggplot2_概述

sunqi
2020/7/31

概述

年初的时候我好像打算对ggplot2进行一个教程，后来因为其他事情耽搁了，今天打开以往的git日志，才发现有这么一个坑（ggplot2初探），虽然现在绘图的包层出不穷，但是ggplot真的是一个基础的绘图包了。

ggplot2 介绍

语法构成

GGPlot2是一个强大而灵活的R包，由HadleyWickham实现， ggplot2中的gg表示Grammar of graphics，ggplot通过使用“语法”来描述图形,基本部分为: plot =data Aesthetics Geometry:

data: a data frame aesthetics: 用于表示x和y变量。它也可以用来控制颜色，大小和形状的点，等等 geometry: 几何:对应于图形的类型(柱状图，盒状图，线状图，…)

主要的函数

Plot types

GGPlot2 functions

Initialize a ggplot

ggplot()

Scatter plot

geom_point()

Box plot

geom_boxplot()

Violin plot

geom_violin()

strip chart

geom_jitter()

Dot plot

geom_dotplot()

Bar chart

geom_bar() or geom_col()

Line plot

geom_line()

Histogram

geom_histogram()

Density plot

geom_density()

Error bars

geom_errorbar()

QQ plot

stat_qq()

ECDF plot

stat_ecdf()

Title and axis labels

labs()

例子

对iris数据集进行绘制散点图

代码语言：javascript复制
library(ggplot2)
ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width)) 
  geom_point()
代码语言：javascript复制
# 更改点的大小颜色形状
ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width)) 
  geom_point(size = 1.2, color = "steelblue", shape = 21)
代码语言：javascript复制
# 添加分组，这里在geom_point中使用aes
ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width)) 
  geom_point(aes(color = Species, shape = Species))
代码语言：javascript复制
# Change the default color manually.
# 使用scale_color_manual() 函数更改配色方案
p <- ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width)) 
  geom_point(aes(color = Species, shape = Species)) 
  scale_color_manual(values = c("#00AFBB", "#E7B800", "#FC4E07"))
print(p)
代码语言：javascript复制
# 更改图例的位置theme
# 上下左右位置left”, “top”, “right”, “bottom”, “none”
p   theme(legend.position = "top")
代码语言：javascript复制
# 标题和轴标签labs()
p   labs(
  title = "Edgar Anderson's Iris Data",
  subtitle = "iris is a data frame with 150 cases (rows) and 5 variables",
  x = "Sepal Length (cm)", y = "Sepal Width (cm)"
  )
代码语言：javascript复制
# 分面问题Facet
ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width)) 
  # 点图分组
  geom_point(aes(color = Species)) 
  # 添加光滑的曲线和置信区间
  geom_smooth(aes(color = Species, fill = Species)) 
  # 使用facet_wrap函数对数据分面展示
  facet_wrap(~Species, ncol = 3, nrow = 1) 
  # 添加配色方案
  scale_color_manual(values = c("#00AFBB", "#E7B800", "#FC4E07")) 
  scale_fill_manual(values = c("#00AFBB", "#E7B800", "#FC4E07"))
代码语言：javascript复制
# ggplot theme
# ggplot的默认主题是theme gray()，它是具有灰色背景和白色网格线的主题。
# 更多的主题包括:theme bw()、theme classic()和theme minimal()
ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width)) 
  geom_point() 
  theme_classic()

图片的保存

ggplot标准绘图流程

  1. 打开绘图设置

pdf(“r-graphics.pdf”) svg(“r-graphics.svg”) png(“r-graphics.png”) tiff(“r-graphics.tiff”) jpeg(“r-graphics.jpg”)

  1. 绘图
  2. 关闭绘图

dev.off()

例子

导出绘图到pdf文件

代码语言：javascript复制
# 绘图
library(ggplot2)
myplot1 <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Sepal.Width))  
  geom_point()
myplot2 <- ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length))  
  geom_boxplot()

# 保存图片到pdf
pdf("ggplot.pdf")
print(myplot1)     # Plot 1 --保存到第一页
print(myplot2)     # Plot 2 ---保存到第二页
dev.off()
代码语言：javascript复制
## png
##   2
代码语言：javascript复制
# 保存png格式
png("myplot.png")
print(myplot1)
dev.off()
代码语言：javascript复制
## png
##   2
代码语言：javascript复制
# 绝大多数的时候我用的是ggsave函数

# 1. 建立图形文件
ggplot(mtcars, aes(wt, mpg))   geom_point()
代码语言：javascript复制
# 2.1. 保存pdf，这里没有指定保存图形，一般为现在绘图面板中的图形
ggsave("myplot.pdf")
# 2.2 OR save it to png file
ggsave("myplot.png")

结束语

今天是公众号创立以来的第100篇文章，转眼间已经过去这么长时间了，物是人非，再回首，有些人背叛了革命，有些人迷失在了熙熙攘攘的人海，总归是意难平。

未来，希望能够继续完善这个公号，不负年华。

最后，不要温柔走入那良夜。

love&peace

data ggplot2 graphics pdf plot

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