导言
ImageJ是一个很强大的图片处理工具,那么对于我们平时拍的带有荧光色彩的图片,想要测量荧光的强度用来进行定量描述,这些都可以用ImageJ来进行完成,如下图所示,我们可以对其进行荧光强度测定。
软件
FIJI
图文教程
1. 这里我们使用软件内置的图片进行教程的素材,选择荧光细胞的图片进行接下来的分析。
2. 首先将图片进行拆分成单通道的图片才可以进行测量,先点击更改通道。
3. 然后点击拆分通道
4. 就会出现三个通道的图片
5. 我们选中第一个图片C1,选择阈值
6. 选择默认值,勾选Dark background,如果觉得没选中或者选的不好,可以调节上下两个滑动的按钮进行选择,或者选择其他算法。
7. 此时图中的荧光就会被选中。
8. 接下来我们选择要测量的指标,选择Analyze里面的设置测量参数。
9. 勾选平均密度值,限定到阈值,展示标签即可。因为我们所测量的面积,是通过threshold产生,以此来确定我们所需要的测量的选区,所以需要勾选Limited To Threshold,同时有C1,C2,C3多张图片在测量,所以把Display Label也勾选上,以此进行区别。
10. 然后,我们点击一下测量,看看结果。或者直接按快捷键Ctrl M,即可进行测量,此时就会出现我们需要的C1区的荧光强度。
11. 同理,我们进行C2和C3的测量,得到结果。
12. 所以,这张图片的荧光强度就是C1,C2和C3的总和,直接相加进行作图即可。怎么样,学会了么?