组合逻辑生成时钟的典型特征是在网表中我们能够看到LUT（查找表）的输出直接连接或通过BUFG连接到时序逻辑单元比如触发器的时钟端口。最直接的危害是组合逻辑可能会产生毛刺（Glitch），从而导致电路功能错误。看个案例，如下图所示。由于毛刺的存在，计数器多计数了一次，导致错误。
从时序角度而言，组合逻辑生成的时钟会增加时钟线上的延迟，从而导致过大的Clock Skew，最终造成建立时间和保持时间违例。此外，如果有毛刺，毛刺通常很窄，很可能无法满足触发器的Pulse Width要求。还有的工程中尽管没有直接把LUT的输出当作时钟，而是将其通过一个触发器之后再用作时钟，这可以过滤掉毛刺，但同样会增加时钟线上的延迟，导致Clock Skew过大。因此，在FPGA设计中，要避免此类时钟。
拿到一个网表，如何判定设计中是否包含此类时钟呢？从上面的描述可以看到，这类时钟要么是LUT输出，要么是触发器输出，这是第一个特征。第二个特殊，既然是时钟，时钟网线的类型就是LOCAL_CLOCK，根据这两点就能找到时钟管脚，相应的Tcl脚本如下图所示。
代码第2行是找到所有的时钟网线，第3行对该时钟网线进行过滤筛选，凡是与网线相连的pin是输出端口且其REF_PIN_NAME是O（对应LUT输出）或Q（对应触发器输出）的，即为目标时钟端口。代码第4行则是将找到的对象以图形界面方式显示出来。
找到了这类时钟，如何优化呢？如果这类时钟是在MMCM或PLL可生成频率范围内，那么建议用MMCM或PLL生成，尤其是该时钟扇出比较大的时候。如果MMCM或PLL无法生成，且时钟频率很低，例如低于5MHz，而设计已经到了后期，不太可能大范围修改，那么尝试是否可能将该时钟驱动的逻辑都放在一个时钟区域内，同时保证时钟源也在该时钟区域内，这可通过手工布局的方式（画Pblock）实现。这样做对于降低Clock Skew会有些帮助。
