pyrx学习记录
(1)第一部分
1蛋白质下载和准备
- 蛋白质需要从pdb数据库下载,地址如下: RCSB PDB - 1TGM: Crystal structure of a complex formed between group II phospholipase A2 and aspirin at 1.86 A resolution https://www.rcsb.org/structure/1TGM
- 用discovery studio打开蛋白质结构 确定结合位点(active sites)
删除非蛋白质残基
点击左上角file的save as保存为新的pdb格式文件