DoRothEA是一种包含转录因子（TF）与其靶标相互作用的基因集资源。一个TF及其对应靶点的集合被定义为调节子（regulons）。DoRothEA regulons 收集了不同类型的证据，例如文献，ChIP-seq peaks，TF结合位点基序以及从基因表达推断相互作用等。
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DoRothEA regulon可以与几种统计方法结合使用，从而产生一种功能分析工具，以从基因表达数据推断TF活性。通过不考虑TF本身的基因表达，而是考虑其直接转录靶标的mRNA水平来计算活性。
安装以及代码实现：https://bioconductor.org/packages/release/data/experiment/vignettes/dorothea/inst/doc/single_cell_vignette
