ade4TkGUI可视化统计和绘图

2020-06-16 17:31:23 浏览数 (1)

在学习肠型的时侯发现了这个包,发现有图形界面,于是学习和分享一下!

内容基本翻译自官网:http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4TkGUI/home.php?lang=eng

一、ade4TkGUI简介

ade4是里昂大学生物统计学和进化生物学实验室(UMR 5558)开发的R包。其名字来源于生态数据分析:环境科学中的探索性和欧几里得方法 (Data Analysis functions to analyse Ecological and Environmental data in the framework of Euclidean Exploratory methods)。

始于2002年,发现这个R包是提供图形用户界面的。目的是促进对 ade4[1]软件包的访问,尤其是对于初学者或偶尔使用的用户。ade4TkGUI GitHub[2]软件包,正在开发的版本可在此处用于 Mac[3] Windows[4]

二、安装和使用

ade4TkGUIR-Forge[5]软件包。要安装它,只需在R中[6]键入以下命令:

代码语言:javascript复制
install.packages("ade4TkGUI",repos="http://R-Forge.R-project.org")

ade4TkGUI[7] 软件包的主要功能如下:

  • 数据导入[8](读取数据文件和ade4内置数据集)

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  • 基本的多元分析方法[9](ACP,AFC,ACM,PCO)
  • 包括个人组的方法[10]组[11]内/组间分析,判别分析)

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  • 耦合两个表[12](CCA,coinertie,ACPVI,双重PCO)的方法
  • 图形表示[13](因子图)
  • 对偶图的综合视图[14]

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  • 动态因子图[15](探索)

img 基于 因子得分的自动分类[16](ordiClust)

软件包的其他功能(尤其是K-array方法)将在ade4TkGUI的[17]更高版本中添加[18]ade4TkGUI[19]基于软件包tcltk[20],它是R[21]基本分配的一部分。因此,它在所有R[22]均可使用的平台上可用 ,尤其是Linux,Windows和MacOS X(带有X11[23])。两种界面模式(图形和命令行)之间的交互通过以下方式得到促进:

  • 在控制台中显示由图形界面生成的命令
  • 命令历史记录管理
  • 能够在整个图形界面中使用R表达式。

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参考资料

[1]ade4: http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4

[2]GitHub: https://github.com/aursiber/ade4TkGUI

[3]Mac: http://pbil.univ-lyon1.fr/members/thioulouse/bin/macosx/

[4]Windows: http://pbil.univ-lyon1.fr/members/thioulouse/bin/windows/

[5]R-Forge: http://r-forge.r-project.org/

[6]R中: http://cran.univ-lyon1.fr/

[7]ade4TkGUI: http://cran.univ-lyon1.fr/web/packages/ade4TkGUI/index.html

[8]数据导入: http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4TkGUI/pictures/readtable.png

[9]基本的多元分析方法: http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4TkGUI/pictures/pca.png

[10]包括个人组的方法: http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4TkGUI/pictures/between.png

[11]组: http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4TkGUI/pictures/between.png

[12]耦合两个表: http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4TkGUI/pictures/coin.png

[13]图形表示: http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4TkGUI/pictures/classes.png

[14]对偶图的综合视图: http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4TkGUI/pictures/dudi.png

[15]动态因子图: http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4TkGUI/pictures/explore.png

[16]基于因子得分的自动分类: http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4TkGUI/pictures/ordiClust.png

[17]ade4TkGUI的: http://cran.univ-lyon1.fr/web/packages/ade4TkGUI/index.html

[18]添加: http://cran.univ-lyon1.fr/web/packages/ade4TkGUI/index.html

[19]ade4TkGUI: http://cran.univ-lyon1.fr/web/packages/ade4TkGUI/index.html

[20]tcltk: http://www.ci.tuwien.ac.at/Conferences/DSC-2001/Proceedings/Dalgaard.pdf

[21]R: http://cran.univ-lyon1.fr/

[22]R: http://cran.univ-lyon1.fr/

[23]X11: http://developer.apple.com/opensource/tools/X11.html

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