在既往的推文中,我说过几次关于Image Pro Plus测量面积或者面积比的方法。
很多小伙伴还是会在后台咨询如何测量之类的问题?我仔细想了想,很可能是大家还未充分理解什么是目标区域?什么是总面积?所以在遇到实际分析案例时,无法把握测量过程。
实际上,Image Pro Plus测量面积或面积比的核心思想一直都没变。我们要做的仅仅是将目标区域圈选出来,计算面积,然后除以总面积就可以得到面积比。
今天,把这些概念再以例子的形式解释一遍。
1、什么是目标区域?
目标区域即你感兴趣的区域。有人说这不挺简单的的嘛?还用你说。
这一概念初看很简单,事实上隐藏的另一层含义,即你必须将感兴趣的区域选择出来,而无关区域绝对不选。
例1:肝脏纤维化Masson染色图片,需测量胶原面积。↓
有经验的一看就知道,如果我们想要测量图中胶原的总面积,只需要使用Image Pro Plus的Color颜色模式就可以很快的选择蓝色部分,并计算其面积。
例2:胰岛免疫组化染色,需测量标记阳性标记的面积大小。↓
可以看出图中,一共3块区域被呈现棕黄色。标记1所示为测量目标。标记2为假阳性区域。标记3虽是正确标记,但胰岛未拍摄完整。
当我们使用Image Pro Plus测量时,首先需要设定将标记2所示的胰岛用不规则工具圈选为AOI,这样可以将标记1和标记3排除在外,然后才能进行下一步测量。同时,放大后可见胰岛中存在较多的蓝色细胞核,以及其它的未被染上棕色的细胞。所以我们必须通过Image Pro Plus中的HSI颜色模式将这些颜色区分开来,仅计算被该胰岛中被染上颜色的区域。如下↓
小结1:
由上面的例子可以看出,目标区域的选择非常依赖我们对目标区域的解读,明确其医学含义比单纯的测量要重要。记住一个原则:应选尽选,不应选择的绝对不选。
2、什么是总面积?
理解了小结1,对于理解总面积的含义很重要。总面积的正确测量直接关系到“面积比”这个指标的准确性。
很多时候,总面积的含义显得更为复杂。因为它受到了图片特征或组织特征的影响,我们必须要加以甄别。
例3:肝脏HE染色图片
可以看出,同样是肝脏组织的HE染色切片,拍摄倍数也相同。上面一张图片中肝脏组织充满了整张图片,并没有看到明显的空隙或空白,此时肝脏组织总面积就是图片的面积。
但是下面这张图片就存在非常明显的中央静脉,此时肝脏组织的总面积必须要扣除中央静脉处的空白。否则肝脏组织的总面积就会因该误差而变大。
正确做法:采用Image Pro Plus选定图中空白区域作为AOI,测量其面积,然后用图片总面积减去空白区总面积,即可得到准确的组织总面积。
有人可能会说,无所谓啦,就一个孔而已。那么请看下面这张图。↓
还有这张 ↓
由这些例子可以看出,在使用Image Pro Plus时,我们必须要重视图片空白区域的影响,准确测量总面积,否则很可能会影响测量指标的正确性。
举一个很生动的例子:主动脉弓缩窄导致的压力负荷心脏疾病模型中,心肌纤维在早期代偿性肥大,但这种肥大可能并不太明显。若用数据来证明心肌细胞确实肥大了,可以采用Image Pro Plus对相同倍数下的心肌纤维横截面积进行测量,面积越大代表心肌纤维越粗。此时,准确扣除空白区域就显得非常重要了。↓
例4:胰岛某细胞免疫组化染色 ↓
为了证明胰岛中某细胞增生,导致细胞数量增多。从Image Pro Plus测量的角度来看,就是要证明“胰岛中目标细胞的面积/胰岛总面积”这一指标增大,引申一下就是要证明“胰岛中的“阳性标记区域面积/胰岛总面积”增大。
为了达到这个测量目的,我们需要作出如下分析:
(1)正确的选取完整的单个胰岛,勾勒出胰岛轮廓并扣除空白区域,以AOI作为单个胰岛的总面积;
(2)正确圈选并计算该单个胰岛中阳性标记物,排除周围的其它胰岛或假阳性影响;
(3)计算阳性物面积/单个胰岛总面积的比值;
(4)对每个完整的胰岛进行上述测量,计算上述比值,最后求平均值作为该动物胰岛中的阳性物面积/单个胰岛总面积,也就等同于“胰岛中目标细胞的面积/胰岛总面积”这一指标。
小结2:
可以看出,总面积的概念一直在变化,相同样本时,总面积概念受到空白区的影响;不同样本,总面积受到组织特征和医学含义的影响。因此,再次强调正确理解所总面积,对于“面积或面积比”这类的数据有着非常重要的意义。