TFmiR:TF、miRNA、target genes间互作用工具

2020-08-05 09:54:43 浏览数 (1)

简介

TFmiR是一个整合分析TF、miRNA、target genes间互作的免费的网络服务。

service.bioinformatik.uni-saarland.de/tfmir

具体使用方法:

大体上分为四步:

1. 输入用户自定义的miRNA和mRNA集合,可以是发生差异表达或者满足其他筛选标准的集合。

2. 设定阈值,与哪种疾病相关,相关标准选择exprimental,predicted,both

3. 鼠标点击运行即可接下来就可以分析结果了。

4. 结果首先展示疾病的特异网络,只含有疾病相关基因的节点和边的关系;另外一个就是全局的大网。

接下来按节点之间的互作关系分别研究

选择其中的一种互作关系

Interaction里边包含了互作的miRNA-gene对;ORA分析显示了显著富集GO term,KEGG等term的结果;最后是通过网络挖掘出的motif分析。

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