前面提到过Rstudio是一个很好的R集成开发环境,但实际上Rstudio本身是没有太多功能的,它只提供一个可视化的环境,实际上背后还是要调用你本地装的R和R包。那么Rstudio是如何跟本地的R关联起来的呢?
1.首先打开Rsudio,选择Tools->Global options
2.点击Change,然后点击Browse
3.选择本地R的安装路径,一直选到bin下面的x64文件夹就可以了。这里x64表示是64位的电脑,i386是32位的电脑。现在32位的电脑应该已经很少了。
4.点击OK,点击apply,点击OK,然后重启Rstudio。就跟你本地的R关联好了。你本地的R里面装了什么包,Rstudio就能够调用什么包了。
做个测试,我本地安装了做GO和KEGG富集分析用的包,叫做clusterprofiler,当我敲出前四个字母,Rstudio就已经提示匹配到的包的名字了,证明跟我本地的R已经关联起来了。