靡不有初,鲜克有终
1、活性氧物种,氧在电子转移过程中生成的具有较强活性的物质。
2、多顺反子见于原核生物意指一个mRNA分子编码多个多肽链。这些多肽链对应的DNA片段则位于同一转录单位内,各自拥有起点和终点。
3、转录单位是指RNA的合成是由RNA聚合酶(RNA polymerase)催化的。根据这样的过程,一个转录单位(transcription unit)就是从启动子到终止子的一段序列,是一段以一条单链RNA分子为表达产物的DNA片段,这是转录单位的重要特征。原核生物的转录单位往往可以包括一个以上的基因,基因之间为间隔区,转录后形成多顺反子mRNA,可以编码多条不同的多肽链。真核生物的转录单位一般只有一个基因,转录后形成单顺反子mRNA,只编码一条多肽链。
4、共转录:(1)原核生物的基因以多顺反子或操纵子形式存在,被转录为一个共同的信使核糖核酸(mRNA)。(2)通过基因操作使不同的基因同时在细胞或组织中一起转录。
5、皮尔逊相关系数:是用于度量两个变量X和Y之间的相关(线性相关),其值介于-1与1之间。
6、RNA-seq即转录组测序技术,就是把mRNA,smallRNA,and NONcoding RNA等或者其中一些,用高通量测序技术进行测序分析,反映出它们的表达水平。
7、RT—PCR首先经反转录酶的作用,从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。可用于检测细胞中基因表达水平、细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。
8、扩增子(amplicon)为DNA或RNA扩增后的一段核苷酸序列。比如通过PCR扩增得到的某个基因的扩增片段。
9、基因座(locus,loci)又称座位。基因在染色体上所占的位置。在分子水平上,是有遗传效应的DNA序列。形象地说,一对染色体可想象为两条平行线,染色体上一个给定的位置,好比两平行线上的一点或一段,叫做基因座。
10、RPKM是将map到基因的read数除以map到基因组上的所有read数(以million为单位)与RNA的长度(以KB为单位)。同一个样本中基因A和基因B的相对表达量,或者不同样本中,同一个基因的相对表达量。
11、Rho依赖性转录终止:指原核生物转录过程中一种需要依赖Rho因子辅助才能完成转录终止的现象。
12、发夹结构(hairpin structure):RNA是单链线形分子,只有局部区域为双链结构。
13、开放阅读框是结构基因的正常核苷酸序列,从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链,其间不存在使翻译中断的终止密码子。
14、原生动物门(Protozoa)是原生生物界的一门,为最原始、最简单、最低等的生物。它们的主要特征是身体由单个细胞构成的,因此也称为单细胞动物。
15、底物:能和特异的酶结合的物质。