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miRbase 是由曼彻斯特大学的研究人员开发的一个在线的miRNA数据库，该数据库中收录了来自200多个物种，接近4万个miRNA的信息，是最全面的miRNA数据库，网址如下
http://www.mirbase.org/index.shtml
我们可以方便的检索和浏览该数据库中的信息，以human为例， 在Browse菜单中，可以检索到hman的所有miRNA前体，示意如下
ID代表miRNA前体的名字, Accesion代表miRNA 前体的编号;RPM为Reads perl million mapped的缩写，代表miRNA前体的表达量;Chromosome, start,end,strand表示miRNA前体所在的染色体位置信息，Confidence`表示可信度。
以hsa-let-7a-1为例, 点击该链接可以查看详细信息，在详情页面，可以得到这个miRNA前体对应的基因，序列，茎环结构等信息
还可以看到这个miRNA前体产生的的两条成熟的miRNA序列和对应的靶标数据库，示意如下
miRNA靶标注释可以分成以下两大类
1. validated targets
实验验证的靶标结果，对应的数据库如下
- MIRTARBASE
- TARBASE
2. predicted targets
软件预测的结果, 对应的数据库如下
- DIANA-MICROT
- MICRORNA.ORG
- MIRDB
- RNA22-HSA
- TARGETMINER
该数据库是免费下载的，ftp地址如下
ftp://mirbase.org/pub/mirbase/CURRENT/
mirbase数据库还可以为新发现的miRNA指定名称，首选在线提交你的novel micoRNA 的序列，格式如下
然后会以邮件的形式，给你的新的miRNA 进行命名, 格式遵循miRNA命名的统一规范。
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