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IHEC全称如下
International Human Epigenome Consortium
称之为国际人类表观基因组联盟,由来自多个国家和实验室的团队共同参与,致力于提供一个公开免费的人类表观基因组学图谱,包括了正常人类和各种疾病细胞相关的数据。其公开的数据可以通过以下链接进行访问
https://epigenomesportal.ca/ihec/
在这个链接中,不仅提供了human的数据,还包含了小鼠和其他物种的一些数据,以hg38
为例,示意如下
提供了多种浏览方式,也可以通过Data Grid
菜单进行检索和查看,示意如下
通过选择感兴趣的数据集,通过UCSC Genome Browser
可以在基因组浏览器中查看测序深度的分布,示意如下
通过Correlate datasets
可以分析其相关性,结果示意如下
通过Download
菜单,可以下载每个数据集对应的结果文件,示意如下
提供了测序深度的bigwig
文件和peak区间的bigBed
文件,raw_data
表示对应的原始数据的链接。
IHEC
就是一个公共免费的数据中心,可以方便的获取公共的chip_seq数据集。
·end·
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