一文重复一篇四分SCI------基于TCGA和geo的circRNA研究(2)

2020-01-15 17:04:26 浏览数 (1)

背景

环状RNA(circRNAs)是广泛表达的无5′端和3′端的RNA,形成共价封闭的RNA环。在真核生物中,circRNAs最常通过反褶叠产生,在反褶叠过程中,剪接的RNA的5'和3'端共价连接形成包含外显子和/或内含子序列的封闭RNA分子。虽然几十年来已经知道了一些circRNAs的例子,但直到最近高通量RNA的广泛应用测序和生物信息学研究表明,circRNAs是一类在细胞内表达的稳定rna,通常具有组织特异性。circRNAs被认为起作用的一个重要机制是通过吸附miRNAs,将其从编码蛋白的mRNAs中分离出来。假设circRNAs可以作为RNA结合蛋白(RBPs)的海绵吸附作用靶点,RBPs控制转录后基因表达的各个阶段,包括mRNAs的剪接、输出、转换、翻译和定位。通过调节基因表达,RBPs在几乎所有的细胞过程中发挥关键作用,包括增殖、分化、运动、衰老、凋亡,以及细胞对压力、有丝分裂原和免疫触发器的反应。因此,RBPs与多种人类疾病有关,如癌症、肌肉病理学,和神经退行性疾病。

MicroRNAs(miRNAs)是另一类主要的转录后调控因子。它们通过部分互补性结合数以千计的人类转录物,通常通过抑制mRNA翻译和/或稳定性来降低它们的表达。21-23在某些情况下,miRNAs可增强mRNA翻译。MicroRNAs最初被合成为初级(Pri)-microRNA转录物,由微处理器复合物处理成microRNA前体(Pre)-microRNA。 Pre microRNA被导出到细胞质中,在细胞质中由DICER1进一步处理并装载到RNA诱导沉默复合物(RISC)上,以定向到靶向mRNA。

方法

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