图形化开放式生信分析系统开发 - 2 样本信息处理

1

样本编号SampleID、${sn}

字符

系统内唯一编号，用于区别样本，为了便于识别，默认为样本编号内容设计了一套编码规则（非强制） 以样本编号：B1908280744FF 为例：前缀：B代表分析流程的代号，显示该样本用于哪个项目，与 项目编号 字段联动数字：190828，表示该样本录入系统的日期为2019年8月28日数字：0744为样本流水号，自动增加后缀：FF 表示样本类型为FFPE还可以继续增加后缀内容，用于标记试验状态，如L01表示第一次建库D01表示该样本第一次提取 等等，可以根据实际需要自行定义。

2

项目编号SampleProject

字符

分析流程的编号，表示样本的分析项目

3

优先级别SamplePriority

整数

优先级别：数字1-**9，数字越大优先级别越高**

4

报告日期SampleReport

日期

样本项目分析完毕，获得分析报告的日期；如果该字段为空，表示尚未分析，如果非空表示样本已经经过分析。

5

拆分状态DemultiplexStatus

布尔

标记该样本测序仪下机数据是否已经完成拆分

1

样本来源SampleSource

字符

记录样本的来源，医院、实验室、等

2

样本类型SampleType

字符

样本类型，为以下其中之一：**蜡块、血液、唾液、新鲜组织、冰冻组织、其它**

3

取样位置SamplePosi

字符

取样的位置：器官位置

4

取样方法SampleMethod

字符

取样方法：穿刺、抽血、口腔刮棒？

5

取样日期SampleCollect

日期

取样的日期

6

收样日期SampleReceive

日期

收到样本的日期

1

患者编号PatientNumber

字符

系统内唯一编号，用于区别患者，为了便于识别，默认为患者编号内容设计了一套编码规则（非强制） 以样本编号：1908280834为例：数字：190828，表示该样本录入系统的日期为2019年8月28日数字：0834为患者流水号，自动增加 另外，可以根据实际需要自行定义。

2

患者姓名PatientName

字符

患者姓名

3

患者性别PatientGender

字符

患者性别

4

患者年龄PatientAge

整数

患者年龄

5

诊断信息PatientDiag

字符

患者来源于其它渠道的诊断信息

6

临床信息PatientClinic

字符

患者来源于其它渠道的临床信息

1

上机编号RunID、${runid}

字符

对应于Illumina RunID的前两个字段，用于识别下机数据目录

2

测序平台Instrument

字符

用于测序的平台，如：MiSeq，Miniseq/NextSeq

3

I7 Index IDI7_Index_ID

字符

I7 Index ID

4

Index序列Index

字符

I7 Index ID 实际碱基序列

5

I5 Index IDI5_Index_ID

字符

I5 Index ID

6

Index2 序列index2

字符

I5 Index ID 实际碱基序列