关于install_github("jmzeng1314/AnnoProbe")安装问题

2020-02-21 10:18:43 浏览数 (1)

前面看了群主最优秀学徒的笔记：GEO数据挖掘流程——代码版（方便抄袭）惊为天人，居然可以把AnnoProbe用得这么溜！所以我作为群主菜鸡学徒，还是想尝试一下；我的电脑是Mac Pro 目前的Rstudio版本是R version 3.6.1 (2019-07-05) 使用如下代码

代码语言：javascript复制

install_github("jmzeng1314/AnnoProbe")
library(AnnoProbe)

安装这个AnnoProbe总是报错，显示

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"had non-zero exit status"

请教了生信技能树老师，也尝试了下载AnnoProbe包到本地后安装，结果还是失败。绝望到极点，然后查看了一些以往的命令，发现经常出现：

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'tar: Failed to set default locale'

google搜索发现答案：

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#Step 1 (In R Console)
system('defaults write org.R-project.R force.LANG en_US.UTF-8')
#Step 2: Restart R

我尝试着做了一次，然后再通过这个安装命令居然可以了

代码语言：javascript复制

install_github("jmzeng1314/AnnoProbe")

到现在为止我也没完全搞懂咋回事，不过还是沉浸在巨大的喜悦中，从绝望到看到希望的感觉………. 分析可能还是代码的解码方式有问题，请各位老师多指教。

写在后面

其实这个问题，生信技能树群主以前分享过，只不过是生信技能树的教程太多了，没有人静下心来去全部看完！

有些时候警告会变成错误

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