文献解读:一篇利用数据挖掘+实验的文章 常用基础科研套路

2019-09-24 17:27:08 浏览数 (1)

如果你想做实验,但是想不到课题,那就用数据挖掘选题吧!让我们一起挖挖挖!!!

这里分享一篇利用数据挖掘 实验的文章,这篇文章发表在BMC Cancer上,IF为3.28

题目:

ACTL6A expression promotes invasion,metastasis and epithelial mesenchymal transition of colon cancer

文章来源:https://doi.org/10.1186/s12885-018-4931-3

这篇文章是研究ACTL6A表达对结肠癌侵袭、转移、上皮间充质转化的影响。下面,我们来分析一下作者是怎么样做这个课题?

第一步,下载GEO数据进行分析,进行差异分析,证明ACTL6A在结肠癌中高表达(与正常组织相比),然后在oncomine中进行验证,ACTL6A在结肠癌中也是高表达。

第二步,有了第一步的结果,我们可以设计实验了,收集病人样本,提取RNA,进行定量PCR,结果发现ACTL6A也是高表达的,然后进行免疫组化验证,在蛋白水平也存在高表达。

第三步,探讨ACTL6A表达与临床不良性状的相关性

第四步,进行体外实验,证明ACTL6A表达会促进结肠癌细胞转移,侵袭

第五步,进行体外实验,证明ACTL6A 诱导结肠癌细胞上皮间充质转化

做完上面的分析就可以下结论:ACTL6A表达促进结肠癌侵袭、转移、上皮间充质转化。

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